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采用基因芯片技术筛选人小细胞肺癌SH77/CDDP多药耐药相关基因表达谱的研究
引用本文:周向东,钱桂生,刘凌志.采用基因芯片技术筛选人小细胞肺癌SH77/CDDP多药耐药相关基因表达谱的研究[J].第三军医大学学报,2007,29(4):279-283.
作者姓名:周向东  钱桂生  刘凌志
作者单位:第三军医大学新桥医院全军呼吸内科研究所,全军呼吸病研究重点实验室,重庆,400037
基金项目:国家自然科学基金,重庆市应用基础研究基金
摘    要:目的 获得人小细胞肺癌(SCLC)SH77/CDDP 多药耐药(MDR)相关基因表达谱,为进一步阐明顺铂(CDDP)所致SCLC MDR的机制奠定基础.方法 在成功建立CDDP诱导的人SCLC MDR细胞系SH77/CDDP的基础上,分别提取SH77/CDDP 和其亲代SH77细胞的总RNA,反转录合成双链cDNA,通过反转录合成生物素标记的cRNA探针,片段化处理后分别与Affymetrix GeneChip人类U133系列芯片(U133A、U133B,共包含3.9万个转录本,其中有3.3万个已知基因,0.6万个未知的cDNA序列表达标签) 杂交,杂交信号经扫描等处理并用生物信息学对检测结果进行分析.结果 与SH77亲代细胞相比,在SH77/CDDP细胞中有2 389个(6.13%)基因表达增高,其中增高1倍以上的有464个(1.19%),增高2倍以上的有89个(0.23%),增高3倍以上的有26个(0.07%),增高4倍以上的有7个(0.02%).其中差异最显著的36个基因包括 ABCC3、HSP70、CYP26B1、CYP4A11、IGF1R、LOX2、CAP2、LRP2BP、AKNA、ELTD1等,上调幅度2.5~5.1倍,根据Gene Ontology分类和Tree View分析,这36个基因的功能主要为运输、细胞黏附、信号转导、转录和离子结合等.结论 高通量的基因芯片技术筛选出大量CDDP所致SCLC MDR相关基因,对这些耐药相关基因功能的验证有助于揭示CDDP所致人SCLC MDR的发生机制.

关 键 词:肺肿瘤  基因芯片  耐药  顺铂
文章编号:1000-5404(2007)04-0279-05
修稿时间:2006-03-16

Investigation on expression pattern of multidrug resistance-associated gene in human small cell lung cancer cell lines SH77/CDDP using gene chip technique
ZHOU Xiang-dong,QIAN Gui-sheng,LIU Ling-zhi.Investigation on expression pattern of multidrug resistance-associated gene in human small cell lung cancer cell lines SH77/CDDP using gene chip technique[J].Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae,2007,29(4):279-283.
Authors:ZHOU Xiang-dong  QIAN Gui-sheng  LIU Ling-zhi
Institution:Institute of Respiratory Diseases, Xinqiao Hospital, Third Military Medical University, Chongqing 400037, China
Abstract:
Keywords:lung neoplasm  gene chip  drug resistance  cisplatin
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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