| 脂多糖结合蛋白的B细胞抗原表位预测及其效应初步分析 |
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| 引用本文： | 冯起甲,徐智,吴国明,胡川闽,徐顺责,陈维中,郭芮伶.脂多糖结合蛋白的B细胞抗原表位预测及其效应初步分析[J].第三军医大学学报,2008,30(4):292-294. |
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| 作者姓名： | 冯起甲 徐智 吴国明 胡川闽 徐顺责 陈维中 郭芮伶 |
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| 作者单位： | 1. 第三军医大学,新桥医院全军呼吸内科研究所,全军呼吸病研究重点实验室,重庆,400037
2. 第三军医大学,医学检验系临床生物化学教研室,重庆,400038 |
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| 摘 要： | 目的 预测人脂多糖结合蛋白(LBP)的B细胞抗原表位.方法 采用生物信息软件和互联网服务器,预测LBP的二级结构和分析LBP表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),再计算平均抗原指数(AI),预测LBP的B细胞抗原表位.结果 LBP存在多个潜在的抗原表位,247～260序列(FKGEIFHRNHRSPV)的AI(0.040 7)明显高于其他片段,370～379序列(LPSSSKEPVF)和303～325序列(ITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFV)的AI分别是0.033 6和0.029 5.247～260序列是LBP潜在的B细胞优势抗原表位.结论 应用多参数预测到LBP的B细胞抗原表位.
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| 关 键 词： | LBP抗原 表位 B细胞 生物信息学 |
| 文章编号： | 1000-5404（2008）04-0292-03 |
| 收稿时间： | 2007-05-11 |
| 修稿时间： | 2007-09-26 |
Prediction of B-cell antigen epitope on lipopolysaccharide-binding protein |
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| FENG Qi-jia,XU Zhi,WU Guo-ming,HU Chuan-min,XU Shun-gui,CHEN Wei-zhong,GUO Rui-ling.Prediction of B-cell antigen epitope on lipopolysaccharide-binding protein[J].Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae,2008,30(4):292-294. |
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| Authors: | FENG Qi-jia XU Zhi WU Guo-ming HU Chuan-min XU Shun-gui CHEN Wei-zhong GUO Rui-ling |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | LBP antigen B cell epitope bioinformatics |
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