| SARS病毒S蛋白的B细胞表位预测 |
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| 引用本文： | 吕燕波,万瑛,吴玉章.SARS病毒S蛋白的B细胞表位预测[J].第三军医大学学报,2004,26(2):101-103. |
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| 作者姓名： | 吕燕波 万瑛 吴玉章 |
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| 作者单位： | 第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学基础医学部全军免疫学研究所,重庆,400038 |
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| 摘 要： | 目的预测SARS病毒S蛋白的B细胞表位.方法基于SARS 蛋白基因组序列,采用Kyte-Doolittle的亲水性方案,Emini方案和Jameson-Wolf抗原指数方案,辅以对S蛋白的二级结构中的柔性区域的分析,预测SARS病毒S蛋白的B细胞表位.结果推测最有可能的B细胞表位位于S蛋白N端第91～98区段、第1 121～1 153区段和第185～193区段内或它们的附近.其它,如S蛋白N端第1 050～1 059、752～765、41～50、666～674、264～287、340～348、408～416区段和第424～439区段内或附近也可能存在B细胞表位.结论用多参数预测SARS病毒S蛋白的B细胞表位,为分子免疫学的深入研究提供线索.
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| 关 键 词： | SARS病毒 S蛋白 B细胞表位 |
| 文章编号： | 1000-5404(2004)02-0101-03 |
| 修稿时间： | 2003年6月15日 |
Prediction of the B cell epitope for the S protein of SARS coronavirus |
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| LU Yan bo,WAN Ying,WU Yu zhang.Prediction of the B cell epitope for the S protein of SARS coronavirus[J].Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae,2004,26(2):101-103. |
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| Authors: | LU Yan bo WAN Ying WU Yu zhang |
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| Abstract: | Objective To predict the B cell epitopes for S protein of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus. Methods Based on SARS coronavirus genome sequence and the analysis of the flexible regions of secondary structure for S protein, the B cell epitopes for S protein were predicted by methods of Kyte Doolittle hydrophilicity plot, Emini, and Jameson Wolf. Results The computer predicted most possible epitopes for S protein were located within or nearby its N terminal No. 91-98, 1121-1153 and 185-193. The N terminal No. 1050-1059, 752-765, 41-50, 666-674, 264-287, 340-348, 408-416, and 424-439 may be the possible B cell epitopes. Conclusion Prediction of the B cell epitopes for the S protein based on multiple parameters is helpful for the identification of B cell epitopes using experimental methods. |
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| Keywords: | SARS coronavirus S protein B cell epitope |
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