海藻糖低温保存血小板miRNA差异表达分析 |
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引用本文: | 黄梅莓,王世春,张强,宋敏,吴建君,陈敏,陈寒梅,李晨晨,张丹.海藻糖低温保存血小板miRNA差异表达分析[J].第三军医大学学报,2016(18):2066-2070. |
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作者姓名: | 黄梅莓 王世春 张强 宋敏 吴建君 陈敏 陈寒梅 李晨晨 张丹 |
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作者单位: | 400038 重庆,第三军医大学西南医院输血科,中国人民解放军重庆血站 |
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基金项目: | 国家自然科学基金面上项目(81270649)Supported by the General Program of National Natural Science Foundation of China (81270649). |
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摘 要: | 目的 探讨海藻糖低温保存血小板过程中miRNA的变化.方法 收集3份来自相同血型无偿献血员的单采血小板,少量混匀后,平均分为2组.对照组:新鲜血小板组(22℃,100%血浆储存的新鲜血小板2h);实验组:海藻糖低温保存血小板组(10℃,70%海藻糖保存液储存5d);采用高通量测序方法对两组样品进行了Small RNA测序,进行生物信息分析,主要包括已知miRNA鉴定、miRNA差异表达分析及富集分析.结果 2组样品经Small RNA高通量测序,平均每个样品获得了11兆净读值(Clean reads),经过生物信息分析,分别获得了821个已知miRNA.通过差异表达分析,在已知的miRNA中共有460个差异表达miRNA,其中194个miRNA表达上调,266个miRNA表达下调,其中显著差异表达已知miRNA共44个,分别在钙离子通路、MAPK通路、凋亡路径、轴突导向等储存损伤相关路径中富集程度较高.相对于对照组,实验组中hsa-miR-4449、hsa-miR-1296表达显著上调(P <0.01,且差异倍数>2),hsa-miR-665表达被抑制.结论 血小板经过海藻糖低温保存后的miRNA呈现出特征性表达变化,提示miRNA活动参与了低温时海藻糖对血小板储存损伤的保护作用.
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关 键 词: | 血小板 血小板储存损伤 miRNA 高通量测序 |
Differential expression profiles of platelet miRNAs after trehalose cryopreservation |
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Abstract: | |
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Keywords: | platelets platelet storage impairment microRNA high throughput sequencing |
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