| 初步建立真核基因调控元件模块的搜索方法 |
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| 引用本文： | 钟东,张振书,刘宇虎,郑国清,刘小意,卢阳,赵贵军,徐安龙.初步建立真核基因调控元件模块的搜索方法[J].第一军医大学学报,2004,24(2):172-176. |
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| 作者姓名： | 钟东 张振书 刘宇虎 郑国清 刘小意 卢阳 赵贵军 徐安龙 |
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| 作者单位： | [1]第一军医大学南方医院消化科,广东广州510515 [2]中山大学生命科学学院生物化学系,广东广州510275 |
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| 摘 要： | 依据基因调控知识对现有方法进行了综合及改进：(1)在序列搜索方面，结合多序列低分值查询与多个保守片段搜索两种方法获得匹配序列，然后序列相互打分，最后进行聚类分析；(2)在位点搜索方面，综合应用位置权重矩阵、成对寡核苷酸及Smith-Waterman等方法；(3)在分析系统方面，采用面向对象的程序设计方法建立跨平台、可扩展、基于数据库的分析系统。本方法对MHC基因家族的初步分析结果表明，能较准确地找到一些基因调控元件模块所在的区域。
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| 关 键 词： | 真核基因 基因调控 搜索方法 调控元件模块 数据库 |
Establishment of the methods for searching eukaryotic gene cis-regulatory modules. |
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| Dong Zhong,Zhen-shu Zhang,Yu-hu Liu,Guo-qing Zheng,Xiao-yi Liu,Yang Lu,Gui-jun Zhao,An-long Xu.Establishment of the methods for searching eukaryotic gene cis-regulatory modules.[J].Journal of First Military Medical University,2004,24(2):172-176. |
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| Authors: | Dong Zhong Zhen-shu Zhang Yu-hu Liu Guo-qing Zheng Xiao-yi Liu Yang Lu Gui-jun Zhao An-long Xu |
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| Institution: | Department of Gastroenterology, Nanfang Hospital, First Military Medical University, Guangzhou 510515, China. zongjohn@263.net |
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