| 基于计算机辅助水解技术的芝麻寡肽体内转运性质预测 |
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| 引用本文： | 李贡宇,乔连生,陈茜,陈艳昆,刘思佳,张燕玲.基于计算机辅助水解技术的芝麻寡肽体内转运性质预测[J].北京中医药大学学报,2018,41(3):222-226. |
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| 作者姓名： | 李贡宇 乔连生 陈茜 陈艳昆 刘思佳 张燕玲 |
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| 作者单位： | 北京中医药大学中药学院 北京102488;北京中医药大学中药学院 北京102488;北京中医药大学中药学院 北京102488;北京中医药大学中药学院 北京102488;北京中医药大学中药学院 北京102488;北京中医药大学中药学院 北京102488 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，NationalNaturalScienceFoundationofChina |
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| 摘 要： | 目的基于计算机辅助技术预测芝麻寡肽的体内转运性质。方法收集芝麻中主要蛋白序列,以计算机辅助技术进行蛋白模拟消化水解,将水解获得的寡肽构建虚拟结构数据库。构建寡肽转运蛋白2(Pep T2)底物的支持向量机(SVM)模型后,通过数据处理和参数寻优方法挑选最优模型,预测芝麻Pep T2的底物成分。结果芝麻寡肽数据库共包括346条寡肽,利用筛选获得45个描述符,创建了Pep T2底物的SVM模型,模型的准确度、灵敏度和特异性均在85%以上。经受试者工作特征(ROC)分析,其曲线下面积(AUC)0.9。利用Pep T2底物模型预测芝麻寡肽数据库,发现36%的芝麻寡肽具有通过Pep T2转运的潜在活性。结论利用计算机辅助水解技术构建了中药芝麻寡肽数据库,以Pep T2底物SVM模型预测芝麻寡肽的体内转运性质,模型准确、稳定、灵敏、特异性高,为开展寡肽类中药成分的性质研究提供了新的方法。
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| 关 键 词： | 计算机辅助水解 寡肽 芝麻 支持向量机 寡肽转运蛋白2 |
Prediction on transport properties in vivo of oligopeptides peptide in Zhi-ma based on computer-assisted proteolysis |
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| Li Gongyu,Qiao Liansheng,Chen Xi,Chen Yankun,Liu Sijia,Zhang Yanling.Prediction on transport properties in vivo of oligopeptides peptide in Zhi-ma based on computer-assisted proteolysis[J].Journal of Beijing University of Traditional Chinese Medicine,2018,41(3):222-226. |
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| Authors: | Li Gongyu Qiao Liansheng Chen Xi Chen Yankun Liu Sijia Zhang Yanling |
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