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诺如病毒遗传组I型TaqMan—MGB探针实时荧光RT-PCR的研究
引用本文:谭翰清,郭赐贶,谭海芳,陈华,程洁萍,林凤,孔秀珍,丁丽娜.诺如病毒遗传组I型TaqMan—MGB探针实时荧光RT-PCR的研究[J].热带医学杂志,2008,8(10).
作者姓名:谭翰清  郭赐贶  谭海芳  陈华  程洁萍  林凤  孔秀珍  丁丽娜
作者单位:广东省肇庆市疾病预防控制中心,肇庆,526020
基金项目:广东省肇庆市科技创新计划
摘    要:目的建立诺如病毒遗传组I型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR快速、特异、灵敏的检测方法,为疾病预防控制提供可靠的依据。方法根据GenBank诺如病毒遗传组Ⅰ型代表株保守序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,建立一步法实时荧光RT-PCR快速检测反应体系,优化反应条件,评价反应体系的灵敏度、特异性、重复性,并与常规RT-PCR比较。结果诺如病毒遗传组Ⅰ型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR检测时限短,仅1h就出结果,与轮状病毒、腺病毒、星状病毒、甲肝病毒、诺如病毒遗传组Ⅱ型无交叉反应,最低检出下限为100拷贝/反应,比常规RT-PCR灵敏100倍,5份浓度不同的诺如病毒遗传组Ⅰ型标本重复检测5次,平均Ct值变异系数范围为0.39%~1.02%。结论诺如病毒遗传组Ⅰ型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR快速、特异、灵敏、重复性好,可应用于突发公共卫生应急检测和诺如病毒遗传组Ⅰ型监测,提高快速检测能力。

关 键 词:人类杯状病毒  诺如病毒  实时荧光PCR  逆转录PCR

The Study for Genogroup Ⅰ of Norovirns Detection Using TaqMan-MGB Probe-Based Real-Time Fluorescent Reverse Translation Polymerase Chain Reaction
TAN Han-qing,GUO Ci-kuang,TAN Hai-fang,CHEN Hua,CHENG Jie-ping,LIN Feng,KONG Xiu-zhen,DING Lina.The Study for Genogroup Ⅰ of Norovirns Detection Using TaqMan-MGB Probe-Based Real-Time Fluorescent Reverse Translation Polymerase Chain Reaction[J].Journal Of Tropical Medicine,2008,8(10).
Authors:TAN Han-qing  GUO Ci-kuang  TAN Hai-fang  CHEN Hua  CHENG Jie-ping  LIN Feng  KONG Xiu-zhen  DING Lina
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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