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2010年广州市甲型H1N1流感病毒分离株HA基因变异分析
引用本文:许沙沙,常彦敏,徐霖,冯发深,何霞,王铸,张定梅,黎孟枫,曹开源.2010年广州市甲型H1N1流感病毒分离株HA基因变异分析[J].热带医学杂志,2011,11(3):260-263,267.
作者姓名:许沙沙  常彦敏  徐霖  冯发深  何霞  王铸  张定梅  黎孟枫  曹开源
作者单位:1. 中山大学临床检验标准化研究中心,广东广州510080;中山大学中山医学院微生物学教研室,广东广州510080
2. 中山大学临床检验标准化研究中心,广东广州510080;广东省重大传染病预防和控制技术研究中心,广东广州510080
3. 中山大学临床检验标准化研究中心,广东广州,510080
4. 中山大学临床检验标准化研究中心,广东广州510080;中山大学热带病防治研究教育部重点实验室,广东广州510080
5. 中山大学中山医学院微生物学教研室,广东广州510080;广东省重大传染病预防和控制技术研究中心,广东广州510080;中山大学热带病防治研究教育部重点实验室,广东广州510080
6. 中山大学临床检验标准化研究中心,广东广州510080;中山大学中山医学院微生物学教研室,广东广州510080;广东省重大传染病预防和控制技术研究中心,广东广州510080;中山大学热带病防治研究教育部重点实验室,广东广州510080
基金项目:国家重大传染病防治科技重大专项,广东省重大传染病专项
摘    要:目的比较2010年广州市分离到的甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因和2009年中国大陆甲型H1N1流感病毒HA基因的变异情况,为甲型H1N1流感的监测和防控提供理论依据。方法收集2010年广州市有发热和呼吸道症状病人的咽拭子标本,用H1N1流感特异性引物进行PCR检测,扩增分离到的H1N1病毒HA片段,测序后与2009年的H1N1毒株进行比对和分析,并用生物信息学方法对抗原位点和糖基化位点进行分析。结果共收集到426份标本,甲型流感阳性211份,其中H1N1流感4株,与2009年分离的甲型H1N1流感相比,有12个氨基酸碱基位点发生了有意义突变,其中6个位点位于抗原位点上;4株毒株HA基因145位氨基酸都发生了变异;其中2株毒株在第180位氨基酸位点的抗原位点发生了变异。进化分析表明4株毒株与2009年中国大陆分离的8株毒株进化关系较远。结论 2010年广州市甲型H1N1毒株与2009年相比发生了较大变异。HA基因145位和180位氨基酸位点变异对H1N1毒株抗原变异有重要意义。本文分离的A/Guangdong/ZS03/2010(H1N1)和A/Guangdong/ZS01/2010(H1N1)毒株可能已经发生了抗原性漂移。

关 键 词:甲型H1N1流感  血凝素  抗原决定簇

Analysis the variation of HA of influenza H1N1 virus in Guangzhou in 2010
XU Sha-sha,CHANG Yan-min,XU Lin,FENG Fa-shen,HE Xia,WANG Zhu,ZHANG Ding-mei,LI Meng-feng,CAO Kai-yuan.Analysis the variation of HA of influenza H1N1 virus in Guangzhou in 2010[J].Journal Of Tropical Medicine,2011,11(3):260-263,267.
Authors:XU Sha-sha  CHANG Yan-min  XU Lin  FENG Fa-shen  HE Xia  WANG Zhu  ZHANG Ding-mei  LI Meng-feng  CAO Kai-yuan
Institution:XU Sha-sha1,2,CHANG Yan-min1,XU Lin1,3,FENG Fa-shen1,HE Xia1,WANG Zhu1,ZHANG Ding-mei1,4,LI Meng-feng2,CAO Kai-yuan1,4(1.Research Center for Clinical Laboratory Standard,Zhongshan Medical School of Sun Yat-sen University,Guangzhou 510080,2.Department of Medical Microbiology,3.Guangdong Provincial Research Center for Severe Infectious Disease Prevention and Control Technology,4.Key Laboratory of Tropical Disease Co...
Abstract:Objective To compare the variation of HA of influenza A(H1N1) from Guangzhou in 2010 with the influenza A(H1N1) virus from Chinese Mainland in 2009.The results will provide basis for the surveillance of influenza A(H1N1)virus.Methods Specimens were collected from patients with febrile respiratory tract symptoms in Guangzhou in 2010.The specimens were tested for influenza A(H1N1)by PCR using specificity primers.PCR products of HA were sequenced.Then compared with the sequence of influenza A(H1N1)in 2009.The ...
Keywords:influenza A(H1N1) virus  HA  antigen determinant sites  
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