| 基于文本挖掘的高通量癌症基因组数据注释 |
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| 引用本文： | 刘燕,孙月萍,郭臻,侯丽,李姣.基于文本挖掘的高通量癌症基因组数据注释[J].中华医学图书情报杂志,2016,25(12):34-39. |
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| 作者姓名： | 刘燕 孙月萍 郭臻 侯丽 李姣 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院医学信息研究所，北京100020,中国医学科学院医学信息研究所，北京100020,中国医学科学院医学信息研究所，北京100020,中国医学科学院医学信息研究所，北京100020,中国医学科学院医学信息研究所，北京100020 |
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| 基金项目： | 科研基金项目“基于多核学习的语义关系提取算法研究”“中国工程科技知识中心医药卫生专业知识服务系统”（CKCEST-2016-1-1）研究成果之一 |
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| 摘 要： | 癌症基因组学科学计划的实施，推进了分子层面疾病诊断、疾病预防检测和靶向治疗等临床应用，积累了大规模的癌症基因组学数据，对癌症基因组数据进行有效挖掘和利用，成为该领域的研究重点。在高通量癌症基因组学数据挖掘的基础上，以美国国家癌症研究中心的癌症基因组数据为研究对象，利用文本挖掘技术对特异癌症基因加以注释和可视化展示，即从基因功能描述文本中识别疾病实体和药物实体，从临床应用的角度注释高通量数据挖掘结果，便于研究人员从高通量的数据和科学文献中发现疾病、药物及基因之间的关系。
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| 关 键 词： | 癌症基因组 文本挖掘 命名实体识别 数据挖掘 可视化展示 |
| 收稿时间： | 2016/10/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/11/10 0:00:00 |
Text mining-based annotation of high-throughput cancer genome data |
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| LIU Yan,SUN Yue-ping,GUO Zhen,HOU Li and LI Jiao.Text mining-based annotation of high-throughput cancer genome data[J].Chinese Journal of Medical Library and Information Science,2016,25(12):34-39. |
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| Authors: | LIU Yan SUN Yue-ping GUO Zhen HOU Li and LI Jiao |
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| Institution: | Institute of Medical Information, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100020, China,Institute of Medical Information, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100020, China,Institute of Medical Information, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100020, China,Institute of Medical Information, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100020, China and Institute of Medical Information, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100020, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cancer genome Text mining Named entity identification Data mining Visual demonstration |
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