新型甲型H1N1流感病毒深圳分离株HA基因的克隆与进化 |
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引用本文: | 张国良,邹颖,杨辉,朱宇珍,迟宏罡,刘映霞,郑学宝.新型甲型H1N1流感病毒深圳分离株HA基因的克隆与进化[J].中国热带医学,2012,12(8):916-918. |
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作者姓名: | 张国良 邹颖 杨辉 朱宇珍 迟宏罡 刘映霞 郑学宝 |
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作者单位: | 1. 深圳市第三人民医院,广东深圳,518112 2. 广东医学院,广东东莞,523024 |
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基金项目: | 东莞市科技计划项目(No.200910815229);深圳市科技计划项目(No.201002107). |
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摘 要: | 目的 分析2009年新型甲型H1N1流感病毒深圳分离株A/Shenzhen/71/09血凝素(Hemagglufinin,HA)基因序列,探讨其基因变异与分子进化.方法 采用RT-PCR技术扩增A/Shenzhen/71/09 HA基因片段并进行测序,利用Cluster和Mega3.1软件对不同亚型毒株HA基因核苷酸序列进行分析,绘制发育进化树. 结果 A/Shenzhen/71/09毒株HA基因包含HA1和HA2两个片段,长度分别约为1 032bp和669bp,HA蛋白裂解位点为VPSIQSR↓ GLF,不含连续碱性氨基酸.进化分析表明该病毒株与其它亚型病毒株遗传距离较远,而与深圳地区同期分离的其它H1N1毒株高度同源,同源性在99.0%以上.结论 新型甲型H1N1流感病毒HA基因不具备高致病流感病毒序列特征,深圳地区同期分离的毒株变异率低,但仍需密切关注新型甲型流感的传播情况.
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关 键 词: | 甲型H1N1流感病毒 血凝素 进化分析 |
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