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| 靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测和初步验证 | |
| 引用本文： | 杨波,卢学春,刘丽宏,朱宏丽,迟小华,姚善谦,楼方定,于力.靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测和初步验证[J].中华医学杂志,2009,89(24):1714-1716. |
| 作者姓名： | 杨波 卢学春 刘丽宏 朱宏丽 迟小华 姚善谦 楼方定 于力 |
| 作者单位： | 1. 解放军总医院老年血液科,北京,100853 2. 解放军第二六二医院药剂科 3. 解放军总医院血液科,北京,100853 |
| 摘 要： | 目的 筛选具有靶向上调ID4基因表达的药物.方法 钓取ID4基因5'侧翼区3000 bp非编码DNA序列和mRNA序列中的开放阅读框(ORF);利用启动子分析软件在人类转录因子数据库中搜索可能存在的顺式结构;利用基因表达数据库分析影响ID4基因表达的相关药物,并做药物调控人类基因表达谱的相似性分析.将筛选出的活性药物与急性淋巴细胞白血病细胞系MOLT4共培养,RT-PCR方法检测ID4基因在药物作用前后的表达情况.结果 ID4基因具有Ⅱ型启动子,在5'非翻译区的-45 bp处有一个典型的TATA盒.在长度为1300 bp的ID4启动子区,存在多个顺式结构,其中转录因子Spl、c-Myb、环磷腺苷、糖皮质激素受体和雌激素受体可能具有正向调控作用;Wilms瘤基因(WT1)和早期生长反应基因2(EGR2)可能具有负向调控作用.环磷腺苷与ID4基因对人类基因表达谱的调控具有相似性.浓度为0.1 mmol/L的二丁酰环磷腺苷具有诱导MOLT4细胞表达ID4基因的作用.结论 启动子调控序列预测、基因表达谱相似性分析和文献检索相结合的生物信息学分析法有助于寻找调控目的 基因表达的药物.二丁酰环磷腺苷具有诱导IIM基因在白血病细胞中表达的作用. |
| 关 键 词： | 白血病 计算生物学 基因 ID4 |
Experimental identification of drugs with function of targeted up-regulating ID4 expression: bioinformatics-based prediction and preliminary validation |
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| YANG Bo,LU Xue-chun,LIU Li-hong,ZHU Hong-li,CHI Xiao-hua,YAO Shan-qian,LOU Fang-ding,YU Li.Experimental identification of drugs with function of targeted up-regulating ID4 expression: bioinformatics-based prediction and preliminary validation[J].National Medical Journal of China,2009,89(24):1714-1716. | |
| Authors: | YANG Bo LU Xue-chun LIU Li-hong ZHU Hong-li CHI Xiao-hua YAO Shan-qian LOU Fang-ding YU Li |
| Abstract: | |
| Keywords: | Leukemia Computational biology Gene ID4 |
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