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前列腺癌易感位点rs2252004的eQTL和meQTL研究
引用本文:葛雨秋,金 经,马高祥,邵 卫,储海燕,王美林,张正东.前列腺癌易感位点rs2252004的eQTL和meQTL研究[J].南京医科大学学报,2018(1):31-33,87.
作者姓名:葛雨秋  金 经  马高祥  邵 卫  储海燕  王美林  张正东
作者单位:南京医科大学公共卫生学院职业医学与环境卫生学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院职业医学与环境卫生学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院职业医学与环境卫生学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院职业医学与环境卫生学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院职业医学与环境卫生学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院职业医学与环境卫生学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院职业医学与环境卫生学系,江苏 南京 211166
基金项目:国家自然科学基金(81473050),江苏省公共卫生与预防医学优势学科
摘    要:目的:全基因组关联性研究(GWAS)发现rs2252004与前列腺癌的易感性相关,本研究拟进一步探讨rs2252004参与前列腺癌发生的可能分子生物学机制。方法:运用TCGA公共数据库中的基因型、甲基化、基因表达数据,采用线性回归分析rs2252004基因型与其上下游1 Mb区域CpG位点的甲基化水平及相关基因表达的关联性。结果:rs2252004与FGFR2基因上的3个CpG位点的甲基化水平显著相关(cg25294906,P=0.031;cg03552039,P=0.042;cg16499947,P=0.049)。而FGFR2在50例配对的前列腺癌组织和癌旁组织中表达差异有统计学意义(P=9.3×10-11)。与GG基因型相比,rs2252004 GT基因型的前列腺癌患者的FGFR2基因表达量显著降低(P=0.007)。此外,GT/TT基因型与GG基因型患者的FGFR2表达量差异有统计学意义(P=0.006)。结论:rs2252004可能通过影响FGFR2甲基化水平,进而调控FGFR2基因的表达,从而参与前列腺癌的发生。

关 键 词:rs2252004  甲基化  FGFR2  前列腺癌
收稿时间:2016/1/27 0:00:00
修稿时间:2016/5/12 0:00:00

eQTL and meQTL analysis of prostate cancer susceptibility locus rs2252004
Ge Yuqiu,Jin Jing,Ma Gaoxiang,Shao Wei,Chu Haiyan,Wang Meilin and Zhang Zhengdong.eQTL and meQTL analysis of prostate cancer susceptibility locus rs2252004[J].Acta Universitatis Medicinalis Nanjing,2018(1):31-33,87.
Authors:Ge Yuqiu  Jin Jing  Ma Gaoxiang  Shao Wei  Chu Haiyan  Wang Meilin and Zhang Zhengdong
Institution:Department of Environmental Genomics, Jiangsu Key Laboratory of Cancer Biomarkers, Prevention and Treatment, Cancer Center,,,,,
Abstract:
Keywords:rs2252004  methylation  FGFR2  prostate cancer
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