高通量测序分析冠心病患者外周血 LncRNA表达差异

目的：发现外周血中与冠状动脉粥样硬化性心脏病（冠心病）相关的未知长链非编码RNA（LncRNA）。方法：选取临床冠心病组及对照组各3例外周血血浆样本进行LncRNA高通量测序表达谱分析，使用cuffdiff软件获得LncRNA表达谱，计算两组样本间的倍数变化和P?value值，筛选差异表达LncRNA。Q?PCR法验证36对冠心病和正常组外周血浆及外周血单核细胞中的基因表达水平。结果：测序结果分析发现差异表达明显的45个上调表达及29个下调表达的LncRNA。Q?PCR法筛选出3个在冠心病患者外周血单核细胞中上调表达明显的LncRNA：uc003pxg.1，ENST00000565257，ENST00000568324。ROC曲线下面积分别为0.812 5，0.742 4，0.742 4。以上基因在冠心病患者中上调表达均差异显著，与测序结果一致。结论：初步从冠心病患者外周血样本中筛选出上调表达的LncRNA，这为后续深入研究奠定基础，为LncRNA用于冠心病临床早期筛查提供理论依据。