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猪SALL1蛋白分子信息分析及基因敲除细胞系制备
引用本文:李美双,赵丽华,李荣凤.猪SALL1蛋白分子信息分析及基因敲除细胞系制备[J].南京医科大学学报,2022,42(7):941-947.
作者姓名:李美双  赵丽华  李荣凤
作者单位:南京医科大学生殖医学国家重点实验室;江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166;南京医科大学生殖医学国家重点实验室 ;江苏省异种移植重点实验室,江苏 南京 211166
基金项目:国家自然科学基金(31971379)
摘    要:目的:从巴马小型猪SALL1的蛋白结构出发,分析其与人SALL1蛋白的同源性,进一步制备Sall1基因敲除的巴马小型猪胎儿成纤维细胞系,为通过体细胞核移植技术获得猪肾脏发育缺陷模型提供实验材料。方法:利用生物信息学方法分析人、猪、鼠 SALL1 的蛋白结构。利用在线设计软件,在猪 Sall1 基因第 1 外显子区域设计单链引导 RNA(single guide RNA, sgRNA)并将其连接至PX330质粒,构建猪Sall1基因敲除打靶载体。在初步转染细胞的基础上,通过Sall1基因测序分析验证 PX330?sgRNA载体打靶效率,最后将打靶载体转染至原代猪胎儿成纤维细胞(porcine fetal fibroblast,PFF)中,通过药物筛选获得单克隆细胞并鉴定其基因型。结果:生物信息学分析表明,相比小鼠,猪的SALL1蛋白与人SALL1蛋白具有更高的同源性。成功构建猪Sall1基因敲除打靶载体,并获得33个单克隆细胞系,经基因测序鉴定得到16个Sall1双等位基因敲除的细胞系。结论:生物信息学方法验证了人和猪SALL1蛋白具有更高的同源性。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术获得Sall1基因敲除细胞系,为研究Sall1基因在猪肾脏发育过程中的作用提供研究材料,并为下一步获得猪肾脏缺失模型奠定基础。

关 键 词:  Sall1  蛋白结构  CRISPR/Cas9  猪胎儿成纤维细胞

Molecular information analysis of SALL1 protein in pig and establishment of genE-knockout pig cell lines
LI Meishuang,ZHAO Lihu,LI Rongfeng.Molecular information analysis of SALL1 protein in pig and establishment of genE-knockout pig cell lines[J].Acta Universitatis Medicinalis Nanjing,2022,42(7):941-947.
Authors:LI Meishuang  ZHAO Lihu  LI Rongfeng
Abstract:
Keywords:
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