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数目可变串联重复序列用于江苏省168株结核分枝杆菌菌株的基因分型研究
引用本文:许卫国,虞 浩,杨丹丹,吕华坤,周 扬.数目可变串联重复序列用于江苏省168株结核分枝杆菌菌株的基因分型研究[J].南京医科大学学报,2007,27(12):1509-1512.
作者姓名:许卫国  虞 浩  杨丹丹  吕华坤  周 扬
作者单位:江苏省疾病预防控制中心慢传科,江苏南京210009
基金项目:国家自然科学基金 , 江苏省卫生厅科研项目
摘    要:目的:初步了解江苏省结核分枝杆菌临床分离菌株的数目可变串联重复序列(Variable number of tandem repeats,VNTR)的基因型及VNTR基因分布特征.方法:在苏南、苏中、苏北三个地区13个结核病定点诊疗单位收集临床分离菌株.选取结核分枝杆菌基因组中11个具有明显多态性特征的VNTR位点,通过PCR扩增,2%琼脂糖凝胶电泳和Bio Numerics(Version 3.0)软件进行结核菌株VNTR的多态性和聚类分析.结果:共收集到168株结核分枝杆菌.不同的菌株在同一位点上具有多态性.共分为10个基因型(Ⅰ,Ⅱ~Ⅹ型),其中以Ⅷ型为主要基因型,占75.0%、其次为Ⅱ型5.4%、Ⅳ型4.2%、Ⅶ型9.5%.不同地区之间,苏南、苏中、苏北三个地区也都以Ⅷ型为主要基因型,分别占各地区的83.5%,57.1%,76.6%;但是苏南、苏中、苏北三地的Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅶ型菌株分布在各地菌株中的比例有差异显著性(χ2=54.710,P<0.0001),Ⅱ型以苏中为主(11.9%)、Ⅲ型以苏南为主(3.8%)、Ⅳ型以苏南、苏北为主(5.1%与6.4%)、Ⅶ型以苏中为主(31.0%).结论:江苏省的结核分枝杆菌具有明显的多态性,以Ⅷ型为主要流行型,不同地区间同样以Ⅷ型为主要流行型,但菌型分布存在一定的差异.

关 键 词:结核分枝杆菌  多位点数目可变串联重复序列分析  基因分型  可变串联重复序列  江苏省  结核分枝杆菌  菌株分布  基因分型  研究  VNTR  Jiangsu  province  isolated  Mycobacterium  tuberculosis  strains  study  差异显著性  存在  菌型分布  地区间  比例  地区之间  结果  聚类分析
文章编号:1007-4368(2007)12-1509-05
收稿时间:2007-06-22
修稿时间:2007年6月22日

Genotyping study of 168 strains of Mycobacterium tuberculosis isolated from Jiangsu province in VNTR
XU Wei-guo,YU Hao,YANG Dan-dan,LU Hua-kun and ZHOU Yang.Genotyping study of 168 strains of Mycobacterium tuberculosis isolated from Jiangsu province in VNTR[J].Acta Universitatis Medicinalis Nanjing,2007,27(12):1509-1512.
Authors:XU Wei-guo  YU Hao  YANG Dan-dan  LU Hua-kun and ZHOU Yang
Institution:Jiangsu Centers for Diseases Prevention and Control, Nanjing 210009, China,Jiangsu Centers for Diseases Prevention and Control, Nanjing 210009, China,Jiangsu Centers for Diseases Prevention and Control, Nanjing 210009, China,Jiangsu Centers for Diseases Prevention and Control, Nanjing 210009, China,Jiangsu Centers for Diseases Prevention and Control, Nanjing 210009, China
Abstract:
Keywords:Mycobaterium tuberculosis  multi-loci of variable number tandem repeats  gene-typing
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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