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中国人群冠心病相关基因的精细定位研究
引用本文:蒋 祝,孙 洁,蒋 涛,朱 猛,李志华,程 越,陈梦茜,戴俊程,沈 冲,胡志斌.中国人群冠心病相关基因的精细定位研究[J].南京医科大学学报,2019(5):756-761.
作者姓名:蒋 祝  孙 洁  蒋 涛  朱 猛  李志华  程 越  陈梦茜  戴俊程  沈 冲  胡志斌
作者单位:南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166,南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 211166
基金项目:国家自然科学基金重大项目(81390543);江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015A067);江苏高校优势学科建设工程资助项目
摘    要:目的:全基因组关联研究(genome?wide association studies,GWASs)已发现了多个冠心病(coronary heart disease,CHD)易感区域。然而,这些易感区域内的致病基因和真正致病位点尚不清楚。本研究旨在通过对报道的易感区域进行靶向测序来鉴定CHD相关基因和变异。方法:基于GWAS Catalog数据库筛选满足GWAS显著水平的CHD易感位点,经过多个数据库评估和基因功能检索,系统筛选了19个CHD易感区域内的关键基因。针对上述易感基因,在192例中国人群冠心病患者和192例健康对照中进行捕获测序。通过Logistic回归和计数法评估常见、罕见变异与CHD发生之间的关联。对于鉴定的CHD相关变异,采用功能注释和表达数量性状(eQTL)分析来评估其潜在的生物学功能。结果:5个常见变异关联P值<0.05,功能注释表明其中rs12970与心血管组织中APOA1表达增加显著相关。鉴定了3个功能性罕见变异:WDR35 rs139543775、KLHDC10 rs60941031、CTSH rs3129。结论:通过在GWAS报道的区域中进行精细定位研究,为CHD遗传研究提供了新线索,但是仍需进一步大样本研究和功能实验来验证。

关 键 词:冠心病  易感位点  靶向测序  中国人群
收稿时间:2019/1/13 0:00:00

Fine mapping of coronary heart disease associated genes in Chinese population
Jiang Zhu,Sun Jie,Jiang Tao,Zhu Meng,Li Zhihu,Cheng Yue,Chen Mengxi,Dai Juncheng,Shen Chong and Hu Zhibin.Fine mapping of coronary heart disease associated genes in Chinese population[J].Acta Universitatis Medicinalis Nanjing,2019(5):756-761.
Authors:Jiang Zhu  Sun Jie  Jiang Tao  Zhu Meng  Li Zhihu  Cheng Yue  Chen Mengxi  Dai Juncheng  Shen Chong and Hu Zhibin
Abstract:
Keywords:
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