| 应用因特网对SARS病毒M蛋白B细胞抗原表位的预测 |
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| 引用本文： | 王新军,吴海玮,张兆松,季旻珺,王勇,吴观陵.应用因特网对SARS病毒M蛋白B细胞抗原表位的预测[J].南京医科大学学报,2003,23(6):558-561. |
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| 作者姓名： | 王新军 吴海玮 张兆松 季旻珺 王勇 吴观陵 |
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| 作者单位： | 南京医科大学病原生物学系，南京医科大学病原生物学系，南京医科大学病原生物学系，南京医科大学病原生物学系，南京医科大学病原生物学系，南京医科大学病原生物学系 江苏 南京 210029，江苏 南京 210029，江苏 南京 210029，江苏 南京 210029，江苏 南京 210029，江苏 南京 210029 |
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| 基金项目： | 南京市科技局及南京市鼓楼区政府资助(2003) |
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| 摘 要： | 目的：预测SARS冠状病毒M蛋白的B细胞表位。方法：采用EMBOSS软件结合Hopp＆woods亲水性参数、Janin可及性参数、极性参数、柔韧性参数及二级结构方案对SARS冠状病毒M蛋白的B细胞表位进行了预测，并用吴玉章等已建立的B细胞表位预测方法进行评述。结果：SARS冠状病毒M蛋白B细胞识别的表位可能位于第3～13和153～166位氮基酸等区域内或附近，这2个被预测的表位均含有β—转角和无规卷曲结构。结论：该研究对应用合成肽抗原进行SARS早期诊断研究及相关抗体的制备具有重要指导意义。
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| 关 键 词： | SARS冠状病毒 M蛋白 B细胞表位 预测 因特网 |
| 文章编号： | 1007-4368(2003)06-0558-04 |
| 修稿时间： | 2003年7月25日 |
Prediction of B Cell Epitopes for SARS-CoV M Protein Using Various Predictive Algorithms of the World Wide Web |
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| WANG Xin-jun,WU Hai-wei,ZHANG Zhao-song,JI Min-jun,WANG Yong,WU Guan-ling.Prediction of B Cell Epitopes for SARS-CoV M Protein Using Various Predictive Algorithms of the World Wide Web[J].Acta Universitatis Medicinalis Nanjing,2003,23(6):558-561. |
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| Authors: | WANG Xin-jun WU Hai-wei ZHANG Zhao-song JI Min-jun WANG Yong WU Guan-ling |
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| Abstract: | Objective: To predict B cell epitopes in SARS coronavirus(SARS-CoV) M protein. Methods: Various algorithms and methods of World Wide Web (Internet) were used, including EMBOSS program, Hopp & Woods hydrophility, accessibility (janin), polarity, flexibility and secondary structure. Results: It was shown that B cell epitopes of SARS-CoV M protein probably located in or were adjacent to amino acids 3-14 and 150-164. All the 2 predicted epitopes contain (3-turn and random coil structrure. Conclusion: The finding is helpful for further study on SARS diagnosis and preparation of antibody to SARS coronavirus M protein using synthetic peptide approach. |
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| Keywords: | SARS coronavirus M protein B cell epitope prediction World Wide Web |
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