| 基于生物信息学方法分析影响胆管癌发生发展的差异基因 |
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| 引用本文： | 王玉明,邵可,刘一纬,吴晓峰.基于生物信息学方法分析影响胆管癌发生发展的差异基因[J].南京医科大学学报,2022,42(12):1673-1680. |
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| 作者姓名： | 王玉明 邵可 刘一纬 吴晓峰 |
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| 作者单位： | 南京医科大学第一附属医院肝胆中心,江苏 南京 210029 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81472306) |
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| 摘 要： | 目的：通过生物信息学的方法挖掘基因综合表达数据库(GEO)中影响胆管癌(cholangiocarcinoma，CCA)发生发展的核心基因，并分析其生物学功能，为CCA的诊断、治疗和评估预后提供理论依据。方法：分析来自GEO数据库中的3个微阵列数据集(GSE32879、GSE45001和GSE76297)。使用GEO2R进行在线差异基因的分析，DAVID进行差异基因的GO 和KEGG 通路分析。使用STRING和Cytoscape进行蛋白互作网络分析(PPI)和枢纽基因(HUB)的筛选。结果：共筛选出151个上调基因，通过PPI筛选出连接度最高的10个基因，分析发现APOA1、AGXT、F13B、FETUB、FERPINC1、SLC2A2这些枢纽基因过度表达与胆管癌的不良预后相关。结论：通过生物信息学探索的枢纽基因可能在胆管癌的发生发展中起着重要作用，并为进一步研究胆管癌的分子机制提供了一定的理论依据。
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| 关 键 词： | 胆管癌 生物信息学 GEO数据库 枢纽基因 预后 |
Analysis of key genes in cholangiocarcinoma based on GEO database and bioinformatics methods |
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| WANG Yuming,SHAO Ke,LIU Yiwei,WU Xiaofeng.Analysis of key genes in cholangiocarcinoma based on GEO database and bioinformatics methods[J].Acta Universitatis Medicinalis Nanjing,2022,42(12):1673-1680. |
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| Authors: | WANG Yuming SHAO Ke LIU Yiwei WU Xiaofeng |
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| Institution: | Hepatobiliary Center,the First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University,Nanjing 210029 ,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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