卡波氏肉瘤相关疱疹病毒亚型分析研究 |
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引用本文: | 张莹,欧阳新星,曾先聪,俞海洋,李进,刘淑均,王林定.卡波氏肉瘤相关疱疹病毒亚型分析研究[J].中华全科医学,2012,10(11):1774-1775. |
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作者姓名: | 张莹 欧阳新星 曾先聪 俞海洋 李进 刘淑均 王林定 |
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作者单位: | 张莹 (安徽医科大学微生物学教研室,合肥市,230032) ; 欧阳新星 (230032合肥市,安徽医科大学微生物学教研室) ; 曾先聪 (430071武汉市,中国科学院武汉病毒研究所病毒学国家重点实验室) ; 俞海洋 (100039北京市,中国科学院研究生院) ; 李进 (安徽医科大学微生物学教研室,合肥市,230032) ; 刘淑均 (安徽医科大学微生物学教研室,合肥市,230032) ; 王林定 (230039安徽省合肥市蜀山区疾病预防控制中心检验科) |
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基金项目: | 国家"十一五"科技重大专项,湖北省自然科学基金,教育部留学回国人员科研启动资金,病毒学国家重点实验室开放研究基,安徽医科大学博士科研经费资助项目,安徽省教育厅自然科学基金 |
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摘 要: | 卡波氏肉瘤相关疱疹病毒为双链DNA病毒,基因组全长为160~170 kb。该病毒基因最早于1994年由美国哥伦比亚大学病理学家Chang等用代表性差异分析法首先在艾滋病患者并发的卡波氏肉瘤组织中发现。常用于KSHV亚型分析的基因片段有:ORF26、ORF75、K1、K15等。基于ORF26分型,最初采用的是330 bp和233 bp的ORF26基因片段,可将KSHV分为A、B、C三个亚型。目前,根据K1基因的多态性,主要将KSHV分为A、B、C、D、E、F亚型,各亚型在氨基酸水平上具有15%~30%的区别。目前,已知的K15有3个等位基因,分别是:P亚型、M亚型和N亚型。其中,N亚型与M型的核苷酸水平差异则高达90%。基于ORF75可以将KSHV分为A、B、C及N亚型。其中,A亚型主要流行于经典的KS患者,而B、C亚型主要见于非洲地区,同时所有亚型都在美国AIDS相关的KS患者中有发现。
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关 键 词: | 卡波氏肉瘤相关疱疹病毒 ORF26 K1 K15 亚型分析 |
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