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伤寒沙门菌基因组DNA芯片基因表达谱分析技术的建立与优化
引用本文:生秀梅,黄新祥,徐顺高,张海方,许化溪.伤寒沙门菌基因组DNA芯片基因表达谱分析技术的建立与优化[J].江苏大学学报(医学版),2009,19(4):281-285,289.
作者姓名:生秀梅  黄新祥  徐顺高  张海方  许化溪
作者单位:江苏大学基础医学与医学技术学院,江苏,镇江,212013
基金项目:江苏省高校自然科学基金指导项目 
摘    要:目的: 建立和优化基于伤寒沙门菌全基因组DNA芯片的基因表达谱分析技术.方法: 提取伤寒沙门菌野生z66阳性菌株总RNA,以6,9核苷酸随机引物(N6、N9)和(或)基因组特异引物(GDP)反转录合成cDNA,用荧光素Cy5或Cy3直接掺入标记后,与包括伤寒沙门菌4201个蛋白编码基因的伤寒沙门菌全基因组芯片杂交,用芯片扫描仪扫描后获得表达谱分析结果,经过数据标准化处理后进行分析.结果: 采用N9+GDP混合引物,直接掺入法标记时,既能获得较好标记效果,又能节约试剂成本,同时可减少繁琐步骤所引起的不必要失误.结论: 建立的基于伤寒沙门菌基因组DNA芯片的基因表达谱分析技术,为细菌的基因表达调控及功能基因组学研究提供了平台.

关 键 词:伤寒沙门菌  基因组  DNA芯片  基因表达谱

Development and optimization of DNA microarray-based Salmonella enterica serovar Typhi gene expression profiling
SHENG Xiu-mei,HUANG Xin-xiang,XU Shun-gao,ZHANG Hai-fang,XU Hua-xi.Development and optimization of DNA microarray-based Salmonella enterica serovar Typhi gene expression profiling[J].Journal of Jiangsu University Medicine Edition,2009,19(4):281-285,289.
Authors:SHENG Xiu-mei  HUANG Xin-xiang  XU Shun-gao  ZHANG Hai-fang  XU Hua-xi
Abstract:
Keywords:
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