先天性巨结肠肠管lncRNA-mRNA共表达谱芯片初步筛查研究 |
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作者姓名: | 罗 波 刘远梅 冯莎莎 金 祝 刘 毅 汤成艳 王红宇 |
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作者单位: | 1.Department of Paediatrics,Zigong First People’s Hospital;2. Department of Pediatric Surgery,the Affiliated Hospital of Zunyi Medical College;3. Department of Clinical Laboratory,Zigong First People’s Hospital |
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摘 要: | 目的:研究先天性巨结肠(Hirschsprung’s disease,HD)病变段肠管与正常段肠管lncRNA-mRNA表达谱的差异。方法:采用lncRNA-mRNA共表达谱芯片筛查5例HD肠管和5例配对的正常肠管差异表达的lncRNA和mRNA,并以17对样本对其中显著差异的5个lncRNA进行qRT-PCR验证,同时应用生物信息学的方法构建lncRNA-mRNA共表达网络,预测差异lncRNA的靶基因,并对预测的靶基因进行基因本体论(gene ontology,GO)分析和通路(pathway)分析。结果:lncRNA-mRNA共表达谱芯片筛查出HD肠管中存在353个表达上调,474个下调的lncRNA,以及865个上调,461个下调的mRNA。并验证出5个差异表达的lncRNA。lncRNA与mRNA相互关联,通过调控相应的靶mRNA,参与包括细胞增殖、分化和迁移等多种生物学过程,与HD的发病有一定相关性。结论:HD肠管中存在大量差异表达的lncRNA和mRNA。lncRNA和mRNA之间具有广泛的联系,形成共表达网络,lncRNA可能是通过调控相应的靶mRNA参与HD的发病。
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关 键 词: | 先天性巨结肠;lncRNA;mRNA |
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