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高通量测序分析5例母婴传播中HBV准种变化趋势
引用本文:陈茹娟,唐 香,赖方方,黄爱龙,任 红,许红梅. 高通量测序分析5例母婴传播中HBV准种变化趋势[J]. 重庆医科大学学报, 2014, 38(10): 1461-1465
作者姓名:陈茹娟  唐 香  赖方方  黄爱龙  任 红  许红梅
作者单位:1. 重庆医科大学附属儿童医院、儿童发育疾病研究省部共建教育部重点实验室、儿科学重庆市重点实验室、重庆市儿童发育重大疾病诊治与预防国际科技合作基地,重庆 400014;2. 重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室,重庆 400014;3. 重庆医科大学病毒性肝炎研究所,重庆 400010;4. 重庆医科大学附属儿童医院感染消化科,重庆 400014
摘    要:目的:探讨5例乙肝疫苗接种失败儿童及其母亲在母婴传播过程中乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)“a”决定簇准种变化趋势。方法:选择5例重庆地区乙肝疫苗接种失败的儿童及其母亲,应用PCR法扩增其HBV基因组全长,构建HBV全基因组测序文库后进行solexa高通量测序,并对测序数据进行生物信息学分析。结果:母子HBV序列同源性为99%~100%;5对母子HBV基因型均为B+C混合型,其中4对优势基因型为B型,1对为C型,母子优势基因型相同;所有儿童均在“a”决定簇存在复杂度明显增高位点;5对母子“a”决定簇复杂度明显增高的氨基酸(Amino acid,aa)位点共有10个,仅存在于儿童的有2个,为aa126和aa143,儿童中有1例发生优势氨基酸突变,突变形式为G145R。结论:乙肝疫苗接种失败儿童在“a”决定簇存在准种现象,儿童体内的突变株可能来源于其母亲。

关 键 词:高通量测序;乙肝病毒;准种;母婴传播

Changing trend of HBV quasispecies in 5 cases of mother-infant transmission detected by high-throughput sequencing
Chen Rujuan,Tang Xiang,Lai Fangfang,Huang Ailong,Ren Hong,Xu Hongmei. Changing trend of HBV quasispecies in 5 cases of mother-infant transmission detected by high-throughput sequencing[J]. Journal of Chongqing Medical University, 2014, 38(10): 1461-1465
Authors:Chen Rujuan  Tang Xiang  Lai Fangfang  Huang Ailong  Ren Hong  Xu Hongmei
Abstract:
Keywords:
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