| 高通量测序分析5例母婴传播中HBV准种变化趋势 |
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| 引用本文： | 陈茹娟,唐 香,赖方方,黄爱龙,任 红,许红梅. 高通量测序分析5例母婴传播中HBV准种变化趋势[J]. 重庆医科大学学报, 2014, 38(10): 1461-1465 |
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| 作者姓名： | 陈茹娟 唐 香 赖方方 黄爱龙 任 红 许红梅 |
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| 作者单位： | 1. 重庆医科大学附属儿童医院、儿童发育疾病研究省部共建教育部重点实验室、儿科学重庆市重点实验室、重庆市儿童发育重大疾病诊治与预防国际科技合作基地，重庆 400014；2. 重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室，重庆 400014；3. 重庆医科大学病毒性肝炎研究所，重庆 400010；4. 重庆医科大学附属儿童医院感染消化科，重庆 400014 |
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| 摘 要： | 目的：探讨5例乙肝疫苗接种失败儿童及其母亲在母婴传播过程中乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）“a”决定簇准种变化趋势。方法：选择5例重庆地区乙肝疫苗接种失败的儿童及其母亲，应用PCR法扩增其HBV基因组全长，构建HBV全基因组测序文库后进行solexa高通量测序，并对测序数据进行生物信息学分析。结果：母子HBV序列同源性为99%～100%；5对母子HBV基因型均为B+C混合型，其中4对优势基因型为B型，1对为C型，母子优势基因型相同；所有儿童均在“a”决定簇存在复杂度明显增高位点；5对母子“a”决定簇复杂度明显增高的氨基酸（Amino acid，aa）位点共有10个，仅存在于儿童的有2个，为aa126和aa143，儿童中有1例发生优势氨基酸突变，突变形式为G145R。结论：乙肝疫苗接种失败儿童在“a”决定簇存在准种现象，儿童体内的突变株可能来源于其母亲。
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| 关 键 词： | 高通量测序；乙肝病毒；准种；母婴传播 |
Changing trend of HBV quasispecies in 5 cases of mother-infant transmission detected by high-throughput sequencing |
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| Chen Rujuan,Tang Xiang,Lai Fangfang,Huang Ailong,Ren Hong,Xu Hongmei. Changing trend of HBV quasispecies in 5 cases of mother-infant transmission detected by high-throughput sequencing[J]. Journal of Chongqing Medical University, 2014, 38(10): 1461-1465 |
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| Authors: | Chen Rujuan Tang Xiang Lai Fangfang Huang Ailong Ren Hong Xu Hongmei |
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