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人宫颈癌基因蛋白B细胞表位及其HLA限制性细胞毒性T细胞表位预测分析
引用本文:刘安定,杨燕,李方和,陆蒙吉,龚非力,杨东亮.人宫颈癌基因蛋白B细胞表位及其HLA限制性细胞毒性T细胞表位预测分析[J].第四军医大学学报,2007,28(14):1260-1263.
作者姓名:刘安定  杨燕  李方和  陆蒙吉  龚非力  杨东亮
作者单位:1. 华中科技大学同济医学院附属同济医院实验医学研究中心,湖北,武汉,430030
2. 华中科技大学同济医学院附属同济医院病原生物学系,湖北,武汉,430030
3. 华中科技大学同济医学院附属同济医院免疫学系,湖北,武汉,430030
4. 华中科技大学同济医学院附属同济医院实验医学研究中心,湖北,武汉,430030;华中科技大学同济医学院附属同济医院临床免疫研究室,湖北,武汉,430030
基金项目:国家自然科学基金,国家重点基础研究发展计划(973计划)
摘    要:目的:预测人宫颈癌基因(human cervical cancer oncogene,HCCR)蛋白的二级结构,B细胞表位及其HLA-A,B限制性细胞毒性T细胞表位.方法:综合分析二级结构、亲水性、柔韧性、表面可及性与抗原性指数,预测HCCR蛋白的B细胞抗原表位;利用BIMAS,SYFPEITHI和NetCTL方法预测分析其HLA-A*0201限制性CTL表位,运用NetCTL方法对HLA-A的其他等位基因和HLA-B限制性CTL表位进行预测分析.结果:HCCR蛋白的二级结构主要由α-螺旋结构组成,B细胞优势表位位于N端第41~53,216~228,310~325和355~360区段;预测得到5个HLA-A*0201限制性CTL优势表位分别为YLVFLLMYL(152~160),YLFPRQLLI(159~167),LLLHNVVLL(343~351),CLFLGIISI(138~146)和SIPPFANYL(145~153),HCCR蛋白HLA-A,B限制CTL表位主要位于胞外区.结论:应用多参数预测HCCR蛋白B细胞表位及其HLA-A,B限制性细胞毒性T细胞表位,为进一步实验鉴定其表位进而制备单克隆抗体和基于HCCR抗原的肿瘤免疫学治疗奠定了基础.

关 键 词:宫颈肿瘤  癌基因蛋白质类  表位  B淋巴细胞  CTL表位
文章编号:1000-2790(2007)14-1260-04
修稿时间:2007-01-262007-02-07

Prediction of B cell epitopes and HLA restricted CTL epitopes of human cervical cancer oncogene protein
LIU An-Ding,YANG Yan,LI Fang-He,LU Meng-Ji,GONG Fei-Li,YANG Dong-Liang.Prediction of B cell epitopes and HLA restricted CTL epitopes of human cervical cancer oncogene protein[J].Journal of the Fourth Military Medical University,2007,28(14):1260-1263.
Authors:LIU An-Ding  YANG Yan  LI Fang-He  LU Meng-Ji  GONG Fei-Li  YANG Dong-Liang
Institution:1 Experimental Medical Center, 4Institute of Clinical Immunology Tongji Hospital, 2 Department of Pathogenic Biology, 3 Department of Immunology, Tongji Medical College, Huanzhong University of Science and Technology, Wuhan 430030, China
Abstract:
Keywords:cervix neoplasms  oncogene proteins  epitopes  B-Lymphocyte  CTL epitopes
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
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