| 高血压相关基因和蛋白质数据库的初构 |
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| 引用本文： | 张其鹏,张丹,刘贝,朱晓华,卢铭,陈光慧,尚彤,汤建.高血压相关基因和蛋白质数据库的初构[J].北京大学学报(医学版),2002,34(2):178-183. |
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| 作者姓名： | 张其鹏 张丹 刘贝 朱晓华 卢铭 陈光慧 尚彤 汤建 |
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| 作者单位： | ^A北京大学心血管研究中心,北京,100083^B北京大学^C1447 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划);G2000056907; |
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| 摘 要： | 目的:构建高血压相关基因和蛋白质数据库,以促进高血压医学生物信息学的研究.方法:以GenBank、LocusLink、GDB、GenCard、Proteome等数据库作为信息数据来源;根据高血压相关信息的内容将数据库设计为基因、蛋白质和功能3部分;编写软件从上述信息资源中获取数据,分类整理,存入数据库,利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索.结果:经过OMIM、文献和相关数据库的检索,目前确定了431个高血压的相关基因,379个蛋白质;建立高血压相关基因和蛋白质数据库,并对其内容进行初步分析.最终实现了网上发布和查询.结论:通过整合现有相关信息,建立一个种类繁多、内容齐全与高血压相关的二级数据库,为高血压和心血管的研究提供一个新的便捷的生物信息查询的工具.
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| 关 键 词： | 高血压 基因 蛋白质类 生物信息学 数据库 文献型 |
| 文章编号： | 1671-167X(2002)02-0178-06 |
The preliminary construction of the database of hypertension related genes and proteins |
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| Abstract: | Objective: To constract hypertension Related Gene and Protein Database and provide a useful query tool for the research of hypertension in biomedical information. Methods: Data are collected from databases such as GenBank, LocusLink, GDB, GenCard, and Proteome. And items of the database are divided into 3 aspects: gene, protein and function. Data were classified, and stored into database by programming and published on web. Results:We found 431 genes and 379 proteins to relate to hypertension from OMIM, related articles and databases. And the contents of database were also analyzed. Conclusion: A complete and content rich database related to hypertension has been constructed, providing a new and useful bioinformatics query tool for hypertension and cardiovascular research. |
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| Keywords: | Hypertension Gene Protein Bioinformatics Database bibliographic |
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