基于TCGA数据库和GEO数据库分析SERPINE1在胃癌中的表达和预后影响 |
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引用本文: | 周涛,王笑天,刘东,孔斌,赵士彭.基于TCGA数据库和GEO数据库分析SERPINE1在胃癌中的表达和预后影响[J].疑难病杂志,2023(1):49-53+66. |
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作者姓名: | 周涛 王笑天 刘东 孔斌 赵士彭 |
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作者单位: | 河北医科大学第三医院胃肠外科 |
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摘 要: | 目的 分析SERPINE1在胃癌组织中的表达及其临床意义。方法 通过检索肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,了解SERPINE1在33种癌症组织中的表达情况。通过检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载375例胃癌组织和32例癌旁组织的RNA-Sep数据和临床信息,通过检索基因综合表达(GEO)数据库GSE54129数据集下载了111例胃癌组织和21例癌旁组织的基因表达谱芯片,分别将TCGA和GSE54129数据集中的SERPINE1进行癌组织和癌旁组织的表达差异分析,COX分析TCGA数据集中临床基线资料和SERPINE1 mRNA表达水平对胃癌患者预后的影响。绘制Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征曲线(ROC)分析SERPINE1 mRNA表达与预后的关系。通过基因富集分析(GSEA)挖掘并预测SERPINE1参与的通路。结果 TIMER数据库分析表明,SERPINE1在8种癌组织中明显高表达(P<0.05)。TCGA数据集、GSE54129数据集分析表明,在胃癌组织中SERPINE1表达高于癌旁组织(P<0.001)。多因素COX分析表明,病理Sta...
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关 键 词: | 胃癌 SERPINE1 癌症基因组图谱数据库 基因表达数据库 预后 |
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