| 单核苷酸多态性(SNP)在近交系小鼠遗传检测中的应用 |
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| 引用本文： | 赵丽亚,张蓉,赵莹,邢正弘,陈国强.单核苷酸多态性(SNP)在近交系小鼠遗传检测中的应用[J].实验动物与比较医学,2016(1):24-31. |
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| 作者姓名： | 赵丽亚 张蓉 赵莹 邢正弘 陈国强 |
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| 作者单位： | 上海西普尔-必凯实验动物有限公司,上海201203;上海实验动物研究中心,上海201203 |
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| 基金项目： | 上海市科学技术委员会科研计划项目 |
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| 摘 要： | 目的 利用单核苷酸多态性(SNP)位点构建多重聚合酶链反应和链接酶反应(PCR-LDR)方案,为近交系小鼠的遗传检测提供一种快速、简便的方法.方法 在SNP公共数据库中挑选51个SNP位点,该51个位点分布于每条常染色体和性染色体,共分为5组,进行多重PCR-LDR方案构建,并将该方案作为遗传质量检测方法对采集的7个近交系样本进行检测.结果 在送检的7个近交系小鼠样本中,纯合度都为100％,相同来源相同品系小鼠的遗传背景一致,但在不同单位的近交系小鼠中,某些SNP位点有差异,CBA/Ca/BK1和CBA/JSlac在a9、a10、b5、b9、c1、c12、e1、e2位点的遗传检测结果不同,C57BL/6/BK1和C57BL/6JS1ac在c7、c10位点的遗传检测结果不同.另外,两家公司各有5个位点在所有品系中基因型相同,因此有效位点数各为46个.结论 构建的多重PCR-LDR方案能有效对两家动物生产单位的近交系小鼠进行检测,可用于常见近交系小鼠快速、高通量的基因分型,有利于大规模遗传质量检测和品系鉴定.
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| 关 键 词： | 遗传质量检测 近交系小鼠 单核苷酸多态性(SNP) 多重聚合酶链反应和链接酶反应(PCR-LDR) 分型方案 |
Application of Single Nucleotide Polymorphism Genotyping Panel in Genetic Monitoring of Laboratory Mice |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Genetic quality monitoring Inbred mice Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) multiple PCR-LDR Genotyping protocol |
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