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光果甘草CHS基因的克隆与多态性分析
引用本文:高智强,胡婷,张晓冬,尹彦超,吴晨华,周姗,马永生,刘颖.光果甘草CHS基因的克隆与多态性分析[J].中国实验方剂学杂志,2018,24(11):32-38.
作者姓名:高智强  胡婷  张晓冬  尹彦超  吴晨华  周姗  马永生  刘颖
作者单位:北京中医药大学生命科学学院
基金项目:北京中医药大学杰出青年人才项目(2016JYBXJQ002)
摘    要:目的:克隆光果甘草Glycyrrhiza glabra查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因并分析其基因多态性。方法:通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从光果甘草主根中扩增得到CHS c DNA序列,测序并运用生物信息学软件对测序结果进行分析。结果:克隆得到19条长度为1 175 bp的光果甘草CHS c DNA序列,测序结果显示其一致性99.10%,存在81个变异位点,可分为17种单倍型;氨基酸序列分析显示,这19条c DNA序列共编码14种氨基酸序列类型,一致性99.34%,存在25个变异位点。生物信息学分析表明光果甘草CHS c DNA序列编码蛋白为稳定性亲水蛋白,平均相对分子质量42.6 k Da,等电点5.75~6.21,不含信号肽,无跨膜区,保守结构域包含1个查尔酮合酶超家族结构域,二级结构以α螺旋和无规卷曲为主。同源性分析显示,光果甘草CHS c DNA序列与乌拉尔甘草G.uralensis以及胀果甘草G.inflata在进化关系上最近,与小立碗藓Physcomitrella patens在进化关系上最远。结论:成功克隆并得到了光果甘草CHS c DNA序列,且这些序列编码区具有丰富的多态性。

关 键 词:光果甘草  查尔酮合酶  克隆  生物信息学  小立碗藓  乌拉尔甘草  胀果甘草
收稿时间:2017/10/2 0:00:00

Molecular Cloning and Polymorphism Analysis of Chalcone Synthase cDNA in Glycyrrhiza glabra
GAO Zhi-qiang,HU Ting,ZHANG Xiao-dong,YIN Yan-chao,WU Chen-hu,ZHOU Shan,MA Yong-sheng and LIU Ying.Molecular Cloning and Polymorphism Analysis of Chalcone Synthase cDNA in Glycyrrhiza glabra[J].China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2018,24(11):32-38.
Authors:GAO Zhi-qiang  HU Ting  ZHANG Xiao-dong  YIN Yan-chao  WU Chen-hu  ZHOU Shan  MA Yong-sheng and LIU Ying
Institution:School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China and School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China
Abstract:
Keywords:Glycyrrhiza glabra  chalcone synthase  cloning  bioinformatics  Physcomitrella patens  G  uralensis  G  inflata
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