| 丹参与红花配伍机制的系统生物学分析 |
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| 引用本文： | 吕燕妮,付龙生,魏筱华.丹参与红花配伍机制的系统生物学分析[J].中国实验方剂学杂志,2015,21(5):220-224. |
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| 作者姓名： | 吕燕妮 付龙生 魏筱华 |
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| 作者单位： | 南昌大学 第一附属医院, 南昌 330046,南昌大学 第一附属医院, 南昌 330046,南昌大学 第一附属医院, 南昌 330046 |
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| 摘 要： | 目的:应用系统生物学方法模拟分析丹红注射液中丹参与红花配伍的分子机制。方法:采用TCMGene DIT和Agilent literature search(ALS)结合搜索方式,挖掘丹参、红花各自作用的蛋白,在BIND,Bio GRID等数据库中查询蛋白间关联,分别构建丹参、红花及丹红注射液蛋白相互作用网络,应用Merge程序中的difference和intersection功能比较网络间异同。结果:采用intersection分析得丹参和红花共有的高连接区蛋白网络含934个蛋白,经cluster ONE方法提取出P0.05的高连接区蛋白子网络4个,Bi NGO插件的基因本位论聚类分析表明,其主要与RNA代谢,核因子kappa B(nuclear factor kappa B,NF-κB)级联反应,脂质代谢,Rho蛋白及小GTP酶调节4类生物学途径相关。将丹红注射液蛋白相互作用网络与丹参、红花共有高连接区蛋白网络进行difference分析,得由1 431个蛋白构成的差异网络,其主要影响细胞增殖、迁移和自噬等。结论:本研究采用系统生物学方法模拟丹参和红花的配伍机制,其可能主要在RNA代谢,NF-κB级联反应以及细胞增殖、迁移和自噬等生物学途径上协同发挥防治疾病的作用。
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| 关 键 词： | 系统生物学 丹红注射液 配伍机制 蛋白相互作用网络 基因本位论 |
| 收稿时间： | 2014/7/10 0:00:00 |
Systems Biology Analysis of Synergistic Mechanisms Between Salviae Miltiorrhizae Radix et Rhizoma and Carthami Flos |
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| LYU Yan-ni,FU Long-sheng and WEI Xiao-hua.Systems Biology Analysis of Synergistic Mechanisms Between Salviae Miltiorrhizae Radix et Rhizoma and Carthami Flos[J].China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2015,21(5):220-224. |
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| Authors: | LYU Yan-ni FU Long-sheng and WEI Xiao-hua |
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| Institution: | The First Affiliated Hospital of Nanchang University Pharmacy, Nanchang 330046, China,The First Affiliated Hospital of Nanchang University Pharmacy, Nanchang 330046, China and The First Affiliated Hospital of Nanchang University Pharmacy, Nanchang 330046, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | systems biology Danhong injection synergistic mechanism protein interaction network gene ontology |
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