| 光果甘草GgUGE基因的克隆和序列分析 |
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| 引用本文： | 侯嘉铭,田少凯,杨林,张智新,高智强,王汉卿,刘颖.光果甘草GgUGE基因的克隆和序列分析[J].中国实验方剂学杂志,2020,26(6):163-167. |
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| 作者姓名： | 侯嘉铭 田少凯 杨林 张智新 高智强 王汉卿 刘颖 |
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| 作者单位： | 北京中医药大学 生命科学学院, 北京 102488,北京中医药大学 生命科学学院, 北京 102488,北京中医药大学 生命科学学院, 北京 102488,北京中医药大学 生命科学学院, 北京 102488,北京中医药大学 生命科学学院, 北京 102488,宁夏医科大学 药学院, 银川 750004,北京中医药大学 生命科学学院, 北京 102488 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（81503181） |
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| 摘 要： | 目的:通过克隆光果甘草Glycyrrhiza glabra UDP-葡萄糖4-差向异构酶(UDP-glucose 4-epimerase,UGE)基因并进行生物信息学分析,探究光果甘草UGE基因与甘草酸生物合成分子调控之间的潜在关系。方法:从光果甘草主根中提取RNA,通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)克隆得到UGE基因c DNA序列,测序并进行序列分析。结果:成功克隆得到一条长度为1 121 bp的光果甘草UGE基因(Gg UGE) c DNA序列,包含1个长度为1 053 bp的开放阅读框(ORF),共编码350个氨基酸残基,在Gen Bank上对所得c DNA序列进行注册,序列注册号为MK638908。序列分析表明Gg UGE基因编码蛋白为不稳定亲水蛋白,理论相对分子质量为39. 02 k Da,等电点为6. 13,不含信号肽,无跨膜区,二级结构以α-螺旋为主,保守结构域含有葡萄糖4-差向异构酶基因家族结构域。Gg UGE基因的c DNA序列和氨基酸序列聚类分析结果表明其与豆科植物亲缘关系最近,而与杨柳科植物亲缘关系较远。结论:首次克隆得到了光果甘草Gg UGE c DNA序列,对其进行了生物信息学分析,为后续Gg UGE基因的功能研究以及甘草酸生物合成分子调控机制的解析提供参考。
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| 关 键 词： | 光果甘草 UDP-葡萄糖4-差向异构酶 甘草酸 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2019/4/29 0:00:00 |
Molecular Cloning and Sequence Analysis of GgUGE Gene in Glycyrrhiza glabra |
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| HOU Jia-ming,TIAN Shao-kai,YANG Lin,ZHANG Zhi-xin,GAO Zhi-qiang,WANG Han-qing and LIU Ying.Molecular Cloning and Sequence Analysis of GgUGE Gene in Glycyrrhiza glabra[J].China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2020,26(6):163-167. |
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| Authors: | HOU Jia-ming TIAN Shao-kai YANG Lin ZHANG Zhi-xin GAO Zhi-qiang WANG Han-qing and LIU Ying |
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| Institution: | School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China,School of Pharmacy, Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China and School of Life Sciences, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 102488, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Glycyrrhiza glabra UDP-glucose 4-epimerase glycyrrhizic acid bioinformatic analysis |
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