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不同产地猫豆遗传多样性的ISSR分析
引用本文:邱亚玲,秦民坚,戴轶群,及佳,谢国勇,吴刚,朱艳.不同产地猫豆遗传多样性的ISSR分析[J].中国实验方剂学杂志,2015,21(6):86-90.
作者姓名:邱亚玲  秦民坚  戴轶群  及佳  谢国勇  吴刚  朱艳
作者单位:中国药科大学 中药资源学教研室, 南京 210009,中国药科大学 中药资源学教研室, 南京 210009,中国药科大学 中药资源学教研室, 南京 210009,中国药科大学 中药资源学教研室, 南京 210009,中国药科大学 中药资源学教研室, 南京 210009,中国药科大学 中药资源学教研室, 南京 210009,中国药科大学 中药资源学教研室, 南京 210009
摘    要:目的:从DNA分子水平分析不同产地猫豆的遗传多样性,探索其相互之间的亲缘关系。方法:采用简单重复序列区间(ISSR)分子标记技术对11份不同产地猫豆进行聚类分析,ISSR-聚合酶链式反应(PCR)扩增程序为94℃预变性4min,94℃变性45s,48~54℃退火1min,72℃延伸90s,40个循环,72℃延伸7min,10℃保存。在单因素试验基础上,通过L16(45)正交试验考察ISSR-PCR的5个主要因素(Mg2+,引物,dNTPs,模板DNA及Taq聚合酶)。运用Ntsys-pc软件和Popgene软件对11份样品进行分析。结果:ISSR-PCR反应最佳体系为模板DNA20ng,0.3μmol·L-1引物,0.15mmol·L-1的dNTPs,2.4mmol·L-1MgCl2,1UTaqDNA聚合酶(5U·μL-1),PCR缓冲液2μL,加入灭菌水至20μL。从40条ISSR引物中筛选出10条扩增条带清晰且重复性良好的引物,共扩增出97个条带,其中多态性条带25条,多态性位点比率25.8%。11份猫豆资源间的遗传相似系数0.866~0.9691,聚类分为3个大类群。结论:猫豆遗传差异与地理分布有一定关系,但整体遗传变异小,遗传稳定性强。

关 键 词:猫豆  ISSR分子标记  遗传关系  聚类分析
收稿时间:2014/7/10 0:00:00

Inter-simple Sequence Repeat Analysis for Genetic Polymorphism of Mucuna pruriens from Different Habitats
QIU Ya-ling,QIN Min-jian,DAI Yi-qun,JI Ji,XIE Guo-yong,WU Gang and ZHU Yan.Inter-simple Sequence Repeat Analysis for Genetic Polymorphism of Mucuna pruriens from Different Habitats[J].China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2015,21(6):86-90.
Authors:QIU Ya-ling  QIN Min-jian  DAI Yi-qun  JI Ji  XIE Guo-yong  WU Gang and ZHU Yan
Institution:Department of Resources Science of Traditional Chinese Medicine, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China,Department of Resources Science of Traditional Chinese Medicine, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China,Department of Resources Science of Traditional Chinese Medicine, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China,Department of Resources Science of Traditional Chinese Medicine, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China,Department of Resources Science of Traditional Chinese Medicine, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China,Department of Resources Science of Traditional Chinese Medicine, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China and Department of Resources Science of Traditional Chinese Medicine, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China
Abstract:
Keywords:Mucuna pruriens  inter-simple sequence repeat molecular markers  genetic relationships  cluster analysis
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