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基于COⅠ基因对东北林蛙、中国林蛙等蛙属24种的鉴定
引用本文:王孟虎,孙一帆,许亮,康廷国,张腾腾,左亚锋,朱丽婷,孟祥松,汤建,徐倩.基于COⅠ基因对东北林蛙、中国林蛙等蛙属24种的鉴定[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(16):150-158.
作者姓名:王孟虎  孙一帆  许亮  康廷国  张腾腾  左亚锋  朱丽婷  孟祥松  汤建  徐倩
作者单位:1.亳州学院,安徽 亳州 236800;2.辽宁中医药大学,辽宁 大连 116600;3.亳州职业技术学院,安徽 亳州 236800;4.安徽中医药大学 第二附属医院,合肥 230061
基金项目:中央本级重大增减支项目(2060302);中药原料产品研发安徽普通高校重点实验室(亳州学院)建设项目(KLAHEI18032);中药学教学团队(亳州学院)(2019jxtd131);亳州市科技重大专项(BKJZD201801);亳州市第二批“首席专家工作室”(亳组2020[2]号);安徽省高等学校省级质量工程项目(2016sxzx027,2016sjjd054);亳州学院校级项目(BYZ2017C02);亳州市科技重大专项(BKJZD201801)
摘    要:目的 利用DNA条形码线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)技术对东北林蛙等24种进行鉴别,构建邻接(NJ)系统发育树,对24种进行系统聚类分析,为东北林蛙等蛙类的鉴别,分类及新种的发现提供一定的依据。方法 收集东北林蛙、中国林蛙、黑龙江林蛙、徂崃林蛙、桓仁林蛙各10只,提取其DNA并进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,将扩增成功的序列测序,共测得50条COⅠ基因序列;从GenBank数据库中获得蛙科蛙属24种163条COⅠ基因序列及蛙科侧褶蛙属,臭蛙属,琴蛙属,水蛙属,湍蛙属各一条COⅠ基因序列;利用MEGA X进行序列比对,分析各物种COⅠ基因序列简约性信息位点,计算种内,种间遗传距离,构建NJ树进行系统聚类分析。结果 东北林蛙等24种COⅠ基因序列长度为554 bp,共有210个简约性信息位点,各物种种内遗传距离均<2%;除桑植蛙与明全蛙种间遗传距离为0.004外,其余各物种种间遗传距离范围为0.024~0.228;桑植蛙与明全蛙聚为一支,部分东北林蛙与Rana uenoi聚为一支,中国林蛙有2个独立的分支,其余各物种均独立聚为一支。结论 DNA条形码COⅠ技术能够对东北林蛙等21种进行鉴定及鉴别,支持桑植蛙与明全蛙,韩国林蛙与昆嵛林蛙为同物异名,其中一支中国林蛙可能是蛙科蛙属未下载的4个种之一或新种。这表明DNA条形码COⅠ技术不仅可以鉴定及鉴别东北林蛙等24种蛙类,也可以为蛙科蛙属的分类,新种或亚种的发现提供一定的科学依据。

关 键 词:东北林蛙  中国林蛙  蛙科  蛙属  DNA条形码  线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因(COⅠ)
收稿时间:2021/4/4 0:00:00
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