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滇重楼甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因的分子克隆与分析
引用本文:杨莉,樊小莉,刘琴,王芳,刘静,徐智斌,冯波,周强,王涛.滇重楼甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因的分子克隆与分析[J].中草药,2019,50(6):1435-1441.
作者姓名:杨莉  樊小莉  刘琴  王芳  刘静  徐智斌  冯波  周强  王涛
作者单位:中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院成都生物研究所, 四川 成都 610041
基金项目:四川省科技计划项目(2017SZ0020)秦巴山区地道中药材多元化种植示范与推广;中国科学院STS区域重点项目(KFJ-STS-QYZD-006)秦巴山区特色高效农业关键技术集成与示范
摘    要:目的皂苷是滇重楼的主要药效成分,获取滇重楼皂苷合成途径中关键基因(MVD)的cDNA全长序列,并对该序列进行生物信息学及表达量分析。方法通过同源克隆法得到滇重楼MVD cDNA的保守片段,利用RACE技术获得MVD c DNA全长序列,命名为PpMVD,并进行生物信息学分析,通过实时荧光定量(RT-PCR)法检测PpMVD在滇重楼不同组织中的表达情况。结果 PpMVD基因cDNA全长1 583 bp,开放阅读框(ORF)长1 269 bp,编码422个氨基酸,该蛋白质的相对分子质量为46 820,等电点为5.69,不稳定指数为45.40;滇重楼Pp MVD蛋白质二级结构中含有159个α-螺旋,占37.68%;19个β折叠,占4.50%;69个延伸链,占16.35%;175个无规卷曲,占41.47%;该蛋白没有跨膜螺旋区,且不存在信号肽,其全部氨基酸都位于细胞膜表面;该基因包含MVD1-Superfamily家族的保守结构域,属于GHMP激酶蛋白家族成员;RT-PCR结果显示,滇重楼PpMVD基因在种子、叶片、茎和块茎中均有表达,但表达量呈显著差异(P0.05),由高到低依次为块茎叶片种子茎,其中主要药用组织块茎中表达量最高,为最低表达量(茎)的3.3倍。结论首次克隆了滇重楼Pp MVD cDNA全长序列,并检测了该基因在滇重楼各组织中的表达量,为进一步研究Pp MVD基因在提高皂苷生物合成过程中的影响提供了基础,并对重楼药用资源的可持续利用提供了支持。

关 键 词:滇重楼  PpMVD  基因克隆  表达分析  RACE  RT-PCR
收稿时间:2018/9/5 0:00:00

Molecular cloning and analysis of pyrophospomevalonate decarboxylase gene from Paris polyphylla var. yunnanensis
YANG Li,FAN Xiao-li,LIU Qin,WANG Fang,LIU Jing,XU Zhi-bin,FENG Bo,ZHOU Qiang and WANG Tao.Molecular cloning and analysis of pyrophospomevalonate decarboxylase gene from Paris polyphylla var. yunnanensis[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2019,50(6):1435-1441.
Authors:YANG Li  FAN Xiao-li  LIU Qin  WANG Fang  LIU Jing  XU Zhi-bin  FENG Bo  ZHOU Qiang and WANG Tao
Institution:Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China,Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China,Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China and Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China
Abstract:
Keywords:Paris polyphylla var  yunnanensis (Fanch  ) Hand  -Mazz    PpMVD  gene cloning  expression analysis  RACE  RT-PCR
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