西洋参β-香树脂合成酶基因的克隆和生物信息学分析 |
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引用本文: | 吴 琼,孙 超,陈士林.西洋参β-香树脂合成酶基因的克隆和生物信息学分析[J].中草药,2013,44(11):1476-1480. |
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作者姓名: | 吴 琼 孙 超 陈士林 |
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作者单位: | 1. 桂林医学院药学院,广西桂林,541004 2. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京,100193 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(项目编号:30873459,81260619)广西教育厅高校科研项目(项目编号:201204LX256) |
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摘 要: | 目的 克隆西洋参三萜皂苷生物合成途径关键酶β-香树脂合成酶(bAS)全长cDNA,为研究西洋参皂苷生物合成与次生代谢调控奠定基础.方法 采用大规模ESTs测序和cDNA末端扩增(RACE)技术克隆西洋参bAS基因.结果 获得了西洋参bAS基因全长cDNA,命名为PqbAS(GenBank注册号:JX185490),其核苷酸序列长度为2 309 bp,含有1个开放阅读框,编码631个氨基酸多肽.保守结构域搜索显示PqbAS含有环氧角鲨烯环化酶(OSCs)共有的活性位点和保守基序.Singal P4.0分析表明PqbAS属于非分泌型蛋白,Tmhmm 2.0分析表明其为非跨膜蛋白.实时荧光定量PCR显示PqbAS基因在各个器官中均有表达,在花和幼茎中高表达,根和叶中表达量相对较低.结论 首次克隆了PqbAS基因全长序列,为研究其表达特性以及在三萜皂苷生物合成中的功能奠定了基础.
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关 键 词: | 西洋参 β-香树脂合成酶 分子克隆 实时荧光定量PCR RACE |
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