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基于网络药理学和分子对接技术的金振口服液干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制研究
引用本文:陶晓倩,柯志鹏,张新庄,邓奕,曹泽彧,曹亮,王振中,肖伟.基于网络药理学和分子对接技术的金振口服液干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制研究[J].中草药,2020,51(9):2326-2333.
作者姓名:陶晓倩  柯志鹏  张新庄  邓奕  曹泽彧  曹亮  王振中  肖伟
作者单位:江苏康缘药业股份有限公司, 江苏 连云港 222001;中药制药过程新技术国家重点实验室, 江苏 连云港 222001
基金项目:国家“重大新药创制”科技重大专项:现代中药创新集群与数字制药技术平台(2013ZX09402203)
摘    要:目的通过网络药理学及分子对接技术预测金振口服液(Jinzhen Oral Liquid,JOL)干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法通过文献挖掘以及DisGeNET、OMIM、KEGG、UniProt数据库联用检索与COVID-19相关的蛋白靶点。借助Traditional Chinese Medicine Network(TCMN)信息平台检索JOL中的化合物,运用Cytoscape3.2.1构建药材-化合物-靶点网络来预测JOL治疗COVID-19的活性成分及作用靶点。在RCSBPDB数据库中检索获取新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶(3CLpro)和血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)的晶体结构,借助AutoDock Vina软件将活性化合物与2个蛋白进行分子对接。结果药材-化合物-靶点网络包含异甘草酸内酯、贝母辛、番泻苷B等75个化合物分别来自甘草、大黄和平贝母3味药材,哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(m TOR)、Janus激酶3(JAK3)、丝裂原活化蛋白激酶激酶1(MEK1)等28个靶点。网络特征分析阐明了JOL治疗COVID-19的9个关键化合物(异甘草酸内酯、甘草内酯、去氢鄂贝定碱、desoxo-glabrolid-acetate、贝母辛、贝母素乙、乌苏里啶酮、西贝素和euchrenone A5)以及10个潜在作用靶(m TOR、JAK3、ACE2、TNFA、AKT2、PIK3CA、MEK1、BRD2、ACE、ANPEP)。分子对接显示,JOL中部分活性化合物对3CLpro和ACE2蛋白具有一定的亲和力。结论 JOL可能是通过调节溴结构域包含蛋白2(Brd2)、氨肽酶N(CD13)和ACE2的表达以及干预PI3K/Akt、Jak-STAT、TNF和MAPK信号通路来遏制COVID-19细胞因子风暴的发生和发展,并与3CLpro结合抑制病毒复制,从而有可能对COVID-19有防治作用。

关 键 词:金振口服液  新型冠状病毒  新型冠状病毒肺炎  网络药理学  分子对接技术  细胞因子风暴  血管紧张素转化酶II  PI3K/Akt信号通路  Jak-STAT信号通路  TNF信号通路  MAPK信号通路  异甘草酸内酯  甘草内酯  去氢鄂贝定碱  贝母辛  贝母素乙  乌苏里啶酮  西贝素
收稿时间:2020/3/31 0:00:00

Investigate mechanism of Jinzhen Oral Liquid for prevention COVID-19 based on network pharmacology and molecular docking technology
TAO Xiao-qian,KE Zhi-peng,ZHANG Xin-zhuang,DENG Yi,CAO Ze-yu,CAO Liang,WANG Zhen-zhong,XIAO Wei.Investigate mechanism of Jinzhen Oral Liquid for prevention COVID-19 based on network pharmacology and molecular docking technology[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2020,51(9):2326-2333.
Authors:TAO Xiao-qian  KE Zhi-peng  ZHANG Xin-zhuang  DENG Yi  CAO Ze-yu  CAO Liang  WANG Zhen-zhong  XIAO Wei
Institution:Jiangsu Kanion Pharmaceutical Co., Ltd., Lianyungang 222001, China;State Key Laboratory of New-tech for Chinese Medicine Pharmaceutical Process, Lianyungang 222001, China
Abstract:
Keywords:Jinzhen Oral Liquid  SARS-CoV-2  coronavirus disease 2019  network pharmacology  molecular docking  cytokine storm  angiotensin converting enzyme II  PI3K/Akt pathway  Jak-STAT pathway  TNF pathway  MAPK pathway  isoglabrolide  glabrolide  ebeiedinone  peimisine  peiminine  ussuriedinone  imperialine
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