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基于网络药理学与GEO生信统计的瘀血痹抗类风湿性关节炎的活性成分及作用机制研究
引用本文:孙彩虹,杨志城,房庆伟,吴若铭,李坤,叶冠.基于网络药理学与GEO生信统计的瘀血痹抗类风湿性关节炎的活性成分及作用机制研究[J].中国现代中药,2022,24(4):676-686.
作者姓名:孙彩虹  杨志城  房庆伟  吴若铭  李坤  叶冠
作者单位:上海医药集团股份有限公司 中央研究院,上海 201203
基金项目:上海市科学技术委员会科研计划项目(15DZ1900100)
摘    要:目的 基于网络药理学与基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库挖掘初步揭示瘀血痹胶囊发挥抗类风湿性关节炎(RA)的潜在活性成分及作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库筛选出瘀血痹胶囊活性化学成分、作用靶点及RA靶点,采用STRING 11.0数据库对其交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建,采用Bioconductor数据库进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过GEO数据库下载基因芯片数据(GSE55457),经过基因探针富集分析(GSEA)筛选出差异表达基因,联用分子对接对差异基因与排名靠前的活性化合物进行虚拟验证。结果 筛选出瘀血痹胶囊128个有效成分和85个与RA的交集靶点,其中度值排名靠前的化合物有槲皮素、木犀草素和山柰酚等。GO功能富集结果显示,RA靶点参与生物过程、分子功能、细胞组分的多种调控过程。KEGG通路富集结果显示,炎性因子和受体信号通路可能为瘀血痹胶囊对RA发挥作用的主要通路。差异表达基因与交集靶点交集有白细胞介素-6(IL-6)、DNA修复酶1(PARP1)、核转录因子-κB激酶亚基β抑制剂(IKBKB)、雄激素受体(AR)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、多不饱和脂肪酸5-脂氧合酶(ALOX5)等。分子对接结果显示,β-谷甾醇、鞣花酸、7-O-甲基异鼠李糖醇、木犀草素、槲皮素、异鼠李素、山柰酚、β-胡萝卜素等与差异性基因对接活性较好。结论 瘀血痹胶囊中的β-谷甾醇、木犀草素、槲皮素等核心化合物可能是通过作用于IL-6、PARP1、IKBKB、AR、CASP3等靶点对RA起治疗作用,为瘀血痹胶囊后续深入研究及临床应用提供了数据支持。

关 键 词:类风湿性关节炎  瘀血痹胶囊  网络药理学  基因表达综合数据库  分子对接  作用机制
收稿时间:2021/9/2 0:00:00

Active Ingredients and Mechanism of Yuxuebi Against Rheumatoid Arthritis: Based on Network Pharmacology and GEO
SUN Cai-hong,YANG Zhi-cheng,FANG Qing-wei,WU Ruo-ming,LI Kun,YE Guan.Active Ingredients and Mechanism of Yuxuebi Against Rheumatoid Arthritis: Based on Network Pharmacology and GEO[J].Modern Chinese Medicine,2022,24(4):676-686.
Authors:SUN Cai-hong  YANG Zhi-cheng  FANG Qing-wei  WU Ruo-ming  LI Kun  YE Guan
Institution:Central Research Institute, Shanghai Pharmaceuticals Holding Co., Ltd., Shanghai 201203, China
Abstract:
Keywords:rheumatoid arthritis  Yuxuebi Capsules  network pharmacology  GEO  molecular docking  mechanism of action
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