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基于生物信息学和质谱技术的阿胶特异性肽段筛选与鉴定
引用本文:王芳,范雨,叶茂,曹秀君,童芯锌,彭成,国锦琳.基于生物信息学和质谱技术的阿胶特异性肽段筛选与鉴定[J].中国现代中药,2019,21(9):1256-1261.
作者姓名:王芳  范雨  叶茂  曹秀君  童芯锌  彭成  国锦琳
作者单位:成都中医药大学 中药资源系统研究与开发利用重点实验室 中药材标准化重点实验室,四川成都611137,成都中医药大学 中药资源系统研究与开发利用重点实验室 中药材标准化重点实验室,四川成都611137,成都中医药大学 中药资源系统研究与开发利用重点实验室 中药材标准化重点实验室,四川成都611137,成都中医药大学 中药资源系统研究与开发利用重点实验室 中药材标准化重点实验室,四川成都611137,成都中医药大学 中药资源系统研究与开发利用重点实验室 中药材标准化重点实验室,四川成都611137,成都中医药大学 中药资源系统研究与开发利用重点实验室 中药材标准化重点实验室,四川成都611137,成都中医药大学 中药资源系统研究与开发利用重点实验室 中药材标准化重点实验室,四川成都611137
基金项目:四川省青年科技创新团队项目(19CXTD0055)
摘    要:目的:建立基于生物信息技术和液质联用技术识别特征肽鉴别阿胶的新方法。方法:利用生物信息技术对驴皮、牛皮和猪皮I型胶原蛋白α1链氨基酸序列进行同源性比对发现3种皮类胶原蛋白氨基酸序列存在差异,通过生物学软件模拟胰酶酶解,分析比对驴皮、牛皮、猪皮来源I型胶原蛋白α1链酶解肽段,然后通过实验对样品前处理条件进行系统摸索,采用超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC/Q-TOF-MS)进行验证。结果:筛选出12个驴皮的特异性肽段,鉴定出1个与预测结果一致的驴皮特异性肽段,其质荷比(m/z)为766.4,分子量为1 530.802 2,对应的多肽序列为GEAGPAGPAGPIGPVGAR,利用特征肽段对10组阿胶样品进行鉴定。结论:生物信息技术结合UPLC/Q-TOF-MS检测出的驴皮特征肽可有效、特异、准确地对阿胶药材进行专属性鉴定。

关 键 词:阿胶鉴定  胰酶  特异肽段  生物信息学  超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱
收稿时间:2019/3/20 0:00:00

Screening and Identification of Characteristic Peptides of Donkey-hide Gelatin Based on Bio-informatics Technique and Mass Spectrometry
WANG Fang,FAN Yu,YE Mao,CAO Xiu-jun,TONG Xin-xin,PENG Cheng and GUO Jin-lin.Screening and Identification of Characteristic Peptides of Donkey-hide Gelatin Based on Bio-informatics Technique and Mass Spectrometry[J].Modern Chinese Medicine,2019,21(9):1256-1261.
Authors:WANG Fang  FAN Yu  YE Mao  CAO Xiu-jun  TONG Xin-xin  PENG Cheng and GUO Jin-lin
Abstract:
Keywords:
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