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基于网络药理学和分子对接研究丁香抗流感的作用机制
引用本文:何紫凝,袁中文,冯森玲.基于网络药理学和分子对接研究丁香抗流感的作用机制[J].世界中医药,2022(16).
作者姓名:何紫凝  袁中文  冯森玲
作者单位:广州医科大学附属第三医院药学部/广东省产科重大疾病重点实验室,广州,510150
基金项目:国家自然科学基金青年科学基金项目(81803689);广东省自然科学基金博士启动项目(2018A030310292)
摘    要:目的:探讨丁香抗流感的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和既往文献筛选丁香活性成分。通过数据库SwissTarget Predictiont获得丁香活性成分的相应靶点;采用GeneCards数据库获取流感相关靶点。将二者取交集,获得共同靶点,运用Cytoscape 3.7.2构建“丁香-活性成分-靶点-疾病网络”。运用String数据库构建共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)。利用Metascape进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。用Autodock Vina 1.1.2对丁香活性成分与流感关键蛋白和流感病毒蛋白进行分子对接,并构建其作用网络。结果:从丁香-活性成分-流感靶点-流感网络中获得rhamnazin-3-O-β-D-glucopyranoside、isoquercitrin、quercetin-3-O-β-D-glucuronide、rhamnetin-3-O-β-D-glucuronide-6″-methyl、1,2,3,6-tetra-O-galloylglucose等28个丁香活性成分和MAPKs、TNF、AKT1、TP53、EGFR、CASP3、HSP90AA1等209个丁香治疗流感的靶点。GO富集分析和KEGG富集分析结果显示,丁香治疗流感主要与激活免疫反应,调控酶活性、细胞凋亡、细胞因子等生物过程和调控PI3K-AKT、MAPK、细胞凋亡、趋化因子、甲型流感等信号通路有关。分子对接作用网络显示28个活性成分可与HA、NA、M2等多个流感病毒蛋白结合。结论:丁香可能通过多成分与多个流感病毒蛋白结合,并作用于多靶点,调控多通路,进而影响炎症反应、免疫应答、细胞凋亡和流感病毒复制,达到治疗流感的作用。

关 键 词:网络药理学  丁香  分子对接  流感  流感病毒  靶点  通路  机制
收稿时间:2020/11/16 0:00:00

Anti-influenza Mechanisms of Flos Caryophylli(Clove) Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
HE Zining,YUAN Zhongwen,FENG Senling.Anti-influenza Mechanisms of Flos Caryophylli(Clove) Based on Network Pharmacology and Molecular Docking[J].World Chinese Medicine,2022(16).
Authors:HE Zining  YUAN Zhongwen  FENG Senling
Institution:Department of Pharmacy,The Third Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University/Key Laboratory for Major Obstetric Diseases of Guangdong Province,Guangzhou 510150,China
Abstract:
Keywords:Network pharmacology  Flos Caryophylli(clove)  Molecular docking  Influenza  Influenza virus  Target  Pathway  Mechanism
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