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幽门螺杆菌阳性萎缩性胃炎大鼠生物信息分析及安胃汤影响的研究
引用本文:徐杉,周瑞东,龚纯,蒙毅,张帆,郑景辉,唐友明,朱永苹.幽门螺杆菌阳性萎缩性胃炎大鼠生物信息分析及安胃汤影响的研究[J].世界中医药,2022(10).
作者姓名:徐杉  周瑞东  龚纯  蒙毅  张帆  郑景辉  唐友明  朱永苹
作者单位:1 广西中医药大学,南宁,530200; 2 湖北中医药大学附属公安中医医院,荆州,434300; 3 广西中医药大学附属瑞康医院消化内科,南宁,530011
基金项目:国家自然科学基金项目(81860843);广西自然科学基金项目(2017GXNSFAA198111,2018GXNSFAA281063);广西一流学科建设开放课题自然科学研究项目(2019XK165);广西研究生教育创新计划项目(XYJ20054)
摘    要:目的:基于生物医学大数据筛选幽门螺杆菌(Hp)相关性慢性萎缩性胃炎的关键基因,探索其发病机制及安胃汤对其的影响。方法:从数据库Gene Expression Omnibus(GEO)下载Hp相关性慢性萎缩性胃炎相关芯片数据,利用GEO2R软件筛选出Hp相关性慢性萎缩性胃炎差异基因,进行生物信息学分析,根据蛋白参与通路数量确定核心蛋白,建立Hp阳性慢性萎缩性胃炎大鼠模型,用PCR和蛋白质印迹法(Western Blotting)进行检测并观察安胃汤对其表达的影响。结果:经过检索分析GSE13873和GSE27411系列芯片数据被纳入,取2个芯片交集的20个差异基因进行生物信息学分析,发现载脂蛋白A1、CD36、囊性纤维化穿膜传导调节蛋白(CFTR)可能是信号通路的核心蛋白。Western Blotting及PCR结果显示Hp相关性慢性萎缩性胃炎大鼠胃组织中,CD36蛋白表达下调(P<0.05),载脂蛋白A1和CFTR蛋白表达上调(P<0.05);与模型组比较,实验观察高剂量组、实验观察中剂量组和实验观察低剂量组胃组织中CD36蛋白表达上调,载脂蛋白A1和CFTR表达下调(P<0.05),其与Hp相关性慢性萎缩性胃炎发病关系密切。结论:通过对GEO中Hp相关性慢性萎缩性胃炎芯片生物信息学分析结合Western Blotting及PCR进一步的验证发现载脂蛋白A1、CD36、CFTR作为信号通路的核心蛋白实验结果与生物信息学分析结果一致。

关 键 词:慢性萎缩性胃炎  幽门螺旋杆菌  生物信息学  基因芯片  安胃汤  载脂蛋白A1  CD36  囊性纤维化穿膜传导调节蛋白
收稿时间:2021/5/19 0:00:00

Bioinformatics Analysis of Helicobacter pylori-Positive Rats with Atrophic Gastritis and the Effect of Anwei Decoction
XU Shan,ZHOU Ruidong,GONG Chun,MENG Yi,ZHANG Fan,ZHENG Jinghui,TANG Youming,ZHU Yongping.Bioinformatics Analysis of Helicobacter pylori-Positive Rats with Atrophic Gastritis and the Effect of Anwei Decoction[J].World Chinese Medicine,2022(10).
Authors:XU Shan  ZHOU Ruidong  GONG Chun  MENG Yi  ZHANG Fan  ZHENG Jinghui  TANG Youming  ZHU Yongping
Abstract:
Keywords:Chronic atrophic gastritis  Helicobacter pylori  Bioinformatics  Gene chip  Anwei Decoction  APOA1  CD36  Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator
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