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基于网络药理学与数据挖掘分析中药调节DNA甲基化的用药规律
引用本文:张艳,周庆兵,徐凤芹.基于网络药理学与数据挖掘分析中药调节DNA甲基化的用药规律[J].世界中医药,2022(9).
作者姓名:张艳  周庆兵  徐凤芹
作者单位:1 中国中医科学院西苑医院,北京,100091; 2 中国中医科学院研究生院,北京,100700; 3 中国中医科学院老年病研究所,北京,100091
基金项目:国家自然科学基金面上项目(81973679);国家重点研发计划“中医药现代化研究”专项(2017YFC1700301);中医药传承与创新“百千万”人才(岐黄工程)岐黄学者
摘    要:目的:探究调节DNA甲基化的中药活性成分和用药规律。方法:运用GeneCards数据库获取DNA甲基化相关基因靶点,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)查找靶基因相关的活性成分和中药,纳入条件为类药性≥0.18,口服生物利用度≥30%,构建中药-成分-甲基化靶点作用网络。采用DAVID 6.8数据库分析潜在靶点参与的生物过程及信号通路,同时收集中药功效及性味归经信息,分析调节DNA甲基化的用药规律。结果:获得23个潜在的DNA甲基化靶点,与449个活性成分和342味中药相匹配。其中山柰酚、槲皮素、木犀草素、黄芩素、异鼠李素等可能是干预DNA甲基化的主要活性成分,甘草、半枝莲、丹参、枸杞子、灯盏细辛等可能是干预DNA甲基化的主要中药。相关通路以TNF信号通路、Toll样信号通路等抗炎通路为主。用药规律分析显示,干预DNA甲基化的中药多性寒、味苦,归肝经,具有清热、止痛、补益等功效。结论:本研究系统探讨了中药调节DNA甲基化的活性成分,归纳了中药干预DNA甲基化的用药规律,以期为治疗DNA甲基化相关疾病的实验验证及新药研发提供思路。

关 键 词:DNA甲基化  表观遗传学  数据挖掘  用药规律  网络药理学  活性成分  中药  信号通路
收稿时间:2021/4/7 0:00:00

Medication Rules of Chinese Medicines in Regulating DNA Methylation Based on Network Pharmacology and Data Mining
ZHANG Yan,ZHOU Qingbing,XU Fengqin.Medication Rules of Chinese Medicines in Regulating DNA Methylation Based on Network Pharmacology and Data Mining[J].World Chinese Medicine,2022(9).
Authors:ZHANG Yan  ZHOU Qingbing  XU Fengqin
Institution:1 Xiyuan Hospital,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100091,China; 2 Graduate School,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China; 3 Institute of Geriatrics,Xiyuan Hospital,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100091,China
Abstract:
Keywords:DNA methylation  Epigenetics  Data mining  Medication rule  Network pharmacology  The active ingredient  Traditional Chinese medicine(TCM)  Signaling pathways
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