| 云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析 |
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| 引用本文： | 杨臣臣,龙飞燕,毕艳红,李云龙,王珏,禹文海,井申荣,黄芬.云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析[J].中国人兽共患病杂志,2015,31(6):547-551. |
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| 作者姓名： | 杨臣臣 龙飞燕 毕艳红 李云龙 王珏 禹文海 井申荣 黄芬 |
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| 作者单位： | 昆明理工大学医学院,昆明 650500 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助，云南省自然科学基金，中国博士后科学基金(No.2014M562672)资助;杨臣臣和龙飞燕同等贡献，the Natural Science Foundation of China，the Natural Science Foundation of Yunnan Province in China，the China Postdoctoral Science Foundation |
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| 摘 要： | 目的 对猪戊型肝炎病毒全长基因组进行扩增,分析其进化关系,为HEV的感染性克隆研究奠定基础。方法 利用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-nPCR)和RACE技术对猪粪便中HEV样品进行全基因组扩增,利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和进化树分析。结果 RT-nPCR方法扩增出HEV的 5段目的基因序列和RACE技术扩增出HEV的 5'和3'端,序列比对结果正确,HEV全长扩增成功。同源性分析显示其与新疆株(GU119961)同源性较高(96.1%)。系统进化树显示该病毒属于基因4型h亚型猪HEV。结论 HEV全基因组序列扩增成功,为深入研究HEV奠定基础。
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| 关 键 词： | 猪戊型肝炎病毒 巢式逆转录PCR 全长基因组分析 |
| 收稿时间： | 2015-01-29 |
Amplification and evolution analysis on full-length genome of swine hepatitis E virus |
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| YANG Chen-chen,LONG Fei-yan,BI Yan-hong,LI Yun-long,WANG Jue,YU Wen-hai,JING Shen-rong,HUANG Fen.Amplification and evolution analysis on full-length genome of swine hepatitis E virus[J].Chinese Journal of Zoonoses,2015,31(6):547-551. |
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| Authors: | YANG Chen-chen LONG Fei-yan BI Yan-hong LI Yun-long WANG Jue YU Wen-hai JING Shen-rong HUANG Fen |
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| Institution: | Medical Faculty, Kunming University of Science and Technology, Kunming 650500, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | swine hepatitis E virus RT-nPCR complete genome sequences analysis |
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