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高通量测序在鸟类肠道微生物中的研究进展
引用本文:刘倩,宋文涛,樊国印,熊衍文,陈海婴,吴葵.高通量测序在鸟类肠道微生物中的研究进展[J].中国人兽共患病杂志,2020,36(12):1025-1028.
作者姓名:刘倩  宋文涛  樊国印  熊衍文  陈海婴  吴葵
作者单位:1. 南昌大学公共卫生学院,江西省预防医学重点实验室,南昌 330006;2. 传染病预防控制国家重点实验室研究基地 江西省动物源与媒介生物性传染病重点实验室 南昌市疾病预防控制中心,南昌 330038;3. 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室,北京 102206
基金项目:国家科技重大专项(No. 2018ZX10201001-006); 传染病预防控制国家重点实验室自主研究课题(No. 2019SKLID311)
摘    要:鸟类作为分布广泛、种群数量庞大和高度多样化的物种之一,在病原体传播中发挥了重要作用。本文综述了基于高通量测序技术的3种测序策略(16S rDNA测序、宏基因组测序和宏转录组测序)的特点及其在鸟类肠道菌群多样性、抗生素抗性基因和病原微生物发现中的应用,并对未来发展趋势进行了展望。

关 键 词:高通量测序  鸟类  肠道微生物  16S  rDNA  宏基因组  宏转录组  
收稿时间:2020-04-07

Recent advances in understanding of the avian gut microbiome via high-throughput sequencing
LIU Qian,SONG Wen-tao,FAN Guo-yin,XIONG Yan-wen,CHEN Hai-ying,WU Kui.Recent advances in understanding of the avian gut microbiome via high-throughput sequencing[J].Chinese Journal of Zoonoses,2020,36(12):1025-1028.
Authors:LIU Qian  SONG Wen-tao  FAN Guo-yin  XIONG Yan-wen  CHEN Hai-ying  WU Kui
Abstract:
Keywords:
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