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福建省2005-2008年临床乙脑病毒分离株的序列分析
引用本文:王金章,朱莉莉,汪小瑛,谢剑锋,陈炜,张拥军.福建省2005-2008年临床乙脑病毒分离株的序列分析[J].中国人兽共患病杂志,2010,26(2):120-123.
作者姓名:王金章  朱莉莉  汪小瑛  谢剑锋  陈炜  张拥军
作者单位:福建省疾病预防控制中心;
基金项目:福建省科技厅青年人才项目(No:2006F3028)资助.王金章、朱莉莉同等贡献 
摘    要:目的分析2005-2008年福建乙脑病毒毒株的部分基因组序列,探索乙脑病毒临床分离株的变异和进化。方法临床标本(血清或脑脊液)接种BHK-21细胞,分离乙脑病毒,从培养液上清提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒基因组片段,并进行克隆、测序以及序列分析。结果共分离到5株乙脑病毒。对病毒C/prM区240bp和全长E基因的序列分析表明,近几年的这些临床分离株基因型仍然全部属于G3型。种系发生分析结果显示,新分离株与2002、2003年分离株存在较大同源性。虽然病毒E基因存在少量氨基酸改变,但总体上这些变异不足以影响病毒的致病性。结论近几年福建省的临床乙脑病毒分离株为G3型,新分离株亲缘关系比较接近2002、2003年毒株。

关 键 词:乙脑病毒  序列分析  
收稿时间:2010-02-20

Sequence analysis of clinical Japanese encephalitis viruses isolated from Fujian,2005-2008
WANG Jin-zhang,ZHU Lili,Wang Xiao-ying,XIE Jian-feng,CHEN Wei,ZHANG Yong-jun.Sequence analysis of clinical Japanese encephalitis viruses isolated from Fujian,2005-2008[J].Chinese Journal of Zoonoses,2010,26(2):120-123.
Authors:WANG Jin-zhang  ZHU Lili  Wang Xiao-ying  XIE Jian-feng  CHEN Wei  ZHANG Yong-jun
Institution:WANG Jin-zhang,ZHU Lili,Wang Xiao-ying,XIE Jian-feng,CHEN Wei,ZHANG Yong-jun(Fujian Center for Disease Control , Prevention,Fuzhou 350001,China)
Abstract:Japanese encephalitis virus(JEV) is an important encephalitis virus in Asia,currently both Genotype I(G1) and Genotype III(G3) strains are circulating in China,while JEV isolates from Fujian belonged to G3.In this report,five clinical JEV strains were isolated from specimens of suspected JE patients in Fujian,2005-2008.Phylogenetic analysis of partial C/PrM and full-length E genes revealed these five strains also belonged to G3.Meanwhile,homogeneity analysis indicated that 2005-2008 isolates were closely re...
Keywords:Japanese encephalitis virus  sequence analysis  envelope gene
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