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2011年河南省脑炎患者柯萨奇病毒B5型分离株基因组序列分析
引用本文:马红霞,潘静静,康锴,谢志强,茹维萍,陈豪敏,黄学勇,许汴利.2011年河南省脑炎患者柯萨奇病毒B5型分离株基因组序列分析[J].中华流行病学杂志,2013,34(12):1213-1215.
作者姓名:马红霞  潘静静  康锴  谢志强  茹维萍  陈豪敏  黄学勇  许汴利
作者单位:450016 郑州,河南省疾病预防控制中心;450016 郑州,河南省疾病预防控制中心;450016 郑州,河南省疾病预防控制中心;450016 郑州,河南省疾病预防控制中心;450016 郑州,河南省疾病预防控制中心;450016 郑州,河南省疾病预防控制中心;450016 郑州,河南省疾病预防控制中心;450016 郑州,河南省疾病预防控制中心
基金项目:河南省科技厅项目(122400450357);河南省医学科技攻关计划省部共建项目(20120100
摘    要:目的 分析河南省柯萨奇病毒B5(cvBs)分离株全基因序列,了解其遗传特性。方法 采集2例脑炎患者临床标本,分离病毒,提取病毒阳性分离物RNA,进行RT-PCR扩增,产物直接测序。利用DNAStar 5.01和Mega 5.05软件进行全基因序列拼接及亲缘进化分析。结果 获得2株CVB5分离株(03001N和17Y)全基因组序列,核苷酸长度分别为7408bP和7404 bP,两者核苷酸同源性为97%,同2010年河南CVB5分离株同源性最高,分别为98%和99%。5-UTR分别为747 bP和743 bP<;3-UTR区均为103 bP;病毒基因组编码区全长同为6558 bP,编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白,氨基酸同源性为99%。VPl区系统发生树分析显示,2株CVB5分离株进化关系较近,同近年来国内其他分离株成一簇,而2009年的河南省CVB5分离株同山东省CVB5分离株成一簇。结论河南省内存在不同CVB5株传播链的流行,此次分离株为近几年内的主要流行株。

关 键 词:柯萨奇病毒B5型  脑炎  系统进化分析
收稿时间:2013/8/1 0:00:00

Genome sequences of coxsackievirus B5 isolated from viral encephalitis patients in Henanprovince,2011
Ma Hongxi,Pan Jingjing,Kang Kai,Xie Zhiqiang,Ru Weiping,Chen Haomin,Huang Xueyong and Xu Bianli.Genome sequences of coxsackievirus B5 isolated from viral encephalitis patients in Henanprovince,2011[J].Chinese Journal of Epidemiology,2013,34(12):1213-1215.
Authors:Ma Hongxi  Pan Jingjing  Kang Kai  Xie Zhiqiang  Ru Weiping  Chen Haomin  Huang Xueyong and Xu Bianli
Institution:Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China;Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China;Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China;Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China;Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China;Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China;Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China;Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhon 450016, China
Abstract:
Keywords:Coxsackievirus B5  Encephalitis  Phylogenetic analysis
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