| 应用2种RT-PCR方法检测和分析北京市市场销售牡蛎中诺如病毒基因特征 |
| |
| 引用本文： | 严寒秋,王永全,崔海洋,靳博,高志勇,王全意.应用2种RT-PCR方法检测和分析北京市市场销售牡蛎中诺如病毒基因特征[J].中华流行病学杂志,2022,43(1):92-97. |
| |
| 作者姓名： | 严寒秋 王永全 崔海洋 靳博 高志勇 王全意 |
| |
| 作者单位： | 北京市疾病预防控制中心/北京市预防医学研究中心食物中毒诊断溯源技术北京市重点实验室;北京市西城区疾病预防控制中心 |
| |
| 基金项目： | 首都卫生发展科研专项(2020-2-1011)。 |
| |
| 摘 要： | 目的应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法检测和分析牡蛎中诺如病毒的基因特征。方法应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法, 对2014年11月至2015年10月北京市采集的新鲜市售牡蛎进行诺如病毒GⅠ/GⅡ组并联试验检测, 分析检出率, 应用符合率和一致性检验(Kappa值)对半巢式RT-PCR方法进行可靠性评价, 应用半巢式RT-PCR方法扩增诺如病毒GⅠ/GⅡ衣壳蛋白区基因, 对阳性产物进行测序。采用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对、Mega 6.0软件构建进化树。结果 72份样品中, 实时荧光RT-PCR、半巢式RT-PCR和并联试验的诺如病毒检出率分别为31.94%(23/72)、38.89%(28/72)和48.61%(35/72)。2种方法符合率为73.61%, 中度一致(Kappa值=0.43)。测序成功13株诺如病毒, 11株(7株GⅡ.17、2株GⅡ.4 Sydney2012、1株GⅡ.1和1株GⅡ.21基因型)为2种RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本所得;2株(GⅡ.17和GⅡ.3基因型各1株)为半巢式RT-...
|
| 关 键 词： | 诺如病毒 实时荧光反转录聚合酶链式反应 半巢式反转录聚合酶链式反应 基因特征 牡蛎 |
| 收稿时间： | 2021/5/19 0:00:00 |
Application of two RT-PCR methods for detection of norovirus in market-sold oysters and norovirus genetic characteristic analysis, a survey conducted in Beijing |
| |
| Yan Hanqiu,Wang Yongquan,Cui Haiyang,Jin Bo,Gao Zhiyong,Wang Quanyi.Application of two RT-PCR methods for detection of norovirus in market-sold oysters and norovirus genetic characteristic analysis, a survey conducted in Beijing[J].Chinese Journal of Epidemiology,2022,43(1):92-97. |
| |
| Authors: | Yan Hanqiu Wang Yongquan Cui Haiyang Jin Bo Gao Zhiyong Wang Quanyi |
| |
| Institution: | (Key Laboratory of Diagnostic and Traceability Technologies for Food Poisoning,Beijing Center for Disease Prevention and Control/Beijing Research Center for Preventive Medicine,Beijing 100013,China;Xicheng District Center for Disease Control and Prevention,Beijing 100120,China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Norovirus Real-time RT-PCR Semi-nested RT-PCR Genetic characteristics Oyster |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中华流行病学杂志》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中华流行病学杂志》下载免费的PDF全文 |
|
