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2018年广州市输入型登革病毒3型基因组全序列测定和特征分析
引用本文:
苏文哲,陈宗遒,蒋力云,李意兰,曹毅敏,张颖,曾庆,景钦隆,朱娉婷,胡玉山,狄飚,张周斌.2018年广州市输入型登革病毒3型基因组全序列测定和特征分析[J].现代预防医学,2020,0(6):1082-1086.
作者姓名:
苏文哲
陈宗遒
蒋力云
李意兰
曹毅敏
张颖
曾庆
景钦隆
朱娉婷
胡玉山
狄飚
张周斌
作者单位:
广州市疾病预防控制中心,广东 广州 510440
摘 要:
目的 分析广州市2018年输入型登革热病毒3型(DENV - III)毒生物学来源,为本地登革热防控提供科学依据和基线数据。方法 通过传染病监测网络收集广州市2018年输入型DENV - Ⅲ病例,对患者急性期血清进行病毒分离培养、全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析。结果 共分离到4株DENV - Ⅲ型毒株,株间核苷酸(氨基酸)同源性为91.8%~97.3%(97.6%~99.4%);泰国输入的分离株属于G - I型,与印度尼西亚2016年分离株的距离最近;其余3株分离株属于G - Ⅲ型,在进化树上处于同一分支,分别与老挝、巴基斯坦和新加坡分离株的距离最近;经过比对,4株分离株和13株参考株的E蛋白区域有18个氨基酸位点出现替换,NS1蛋白区域有7个氨基酸位点出现替换,NS5蛋白区域有21个氨基酸位点出现替换。结论 广州市2018年输入型DENV - Ⅲ毒株分属于2个不同的基因型亚群,在进化上距离较远,抗原性差异较大;通过全基因组测序和特征分析,逐步完善周边地区的病毒特征信息,为防控工作提供生物学溯源依据,具有重要意义。
关 键 词:
登革病毒
登革热
全基因组测序
系统进化分析
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