盐城市肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析

目的分析盐城市手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)病原学及分子流行病学特征,了解盐城市近年来HFMD病原学构成和肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)毒株流行概况。方法收集HFMD样本,对阳性标本进行病毒培养和分离,提取病毒RNA,利用逆转录-聚合链酶反应、序列测定和基因进化树构建、同源性分析等方法,对阳性扩增产物进行基因型鉴定。结果盐城市HFMD病原学构成以EV71和CA16循环交替流行为主,其他肠道病毒占较大比例。基因进化树图结果显示:EV71毒株均为C4a亚型,CA16毒株为B1a和B1b亚型交替流行,其中以B1b亚型为流行优势株。同源性分析结果显示:EV71和CA16各亚型之间核苷酸和氨基酸同源性较高,亚型之间亲缘性较近,相对于原始株已发生较大变异。结论盐城市EV71和CA16毒株流行优势株遗传性较稳定,基因亚型与国内外研究结果相一致。