探针ASPCR检测肺炎支原体
微量耐药突变A2063G方法的建立 |
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引用本文: | 郭东星,胡文娟,李?丹,李静宜,吴赵永,栗绍刚,田秀君,辛德莉.探针ASPCR检测肺炎支原体
微量耐药突变A2063G方法的建立[J].中国工业医学杂志,2022,35(5):418-425. |
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作者姓名: | 郭东星 胡文娟 李?丹 李静宜 吴赵永 栗绍刚 田秀君 辛德莉 |
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作者单位: | 首都医科大学附属北京友谊医院北京热带医学研究所;北京,民航总医院儿科 |
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基金项目: | ]北京市科技计划(Z161100000116088);首都卫生发展科研专项(2016-2-2026) |
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摘 要: | 摘要] 目的 建立能够特异性检测微量肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae, MP)A2063G耐药突变基因的特异性扩增等位基因的探针法实时定量PCR(probe-based allele-specific real-time PCR, 探针ASPCR)方法。方法?建立特异性检测A2063G耐药突变位点的探针ASPCR方法,并验证其灵敏度、特异度及准确度等性能。结果?特异性扩增2063G和非特异性扩增2063A/G的引物/探针组合分别扩增105拷贝野生基因型(2063A)模板的Ct值的差(△Ct)高达10.93,能够特异性检测A2063G突变。探针ASPCR方法检测2063G基因型占总MP的比例的准确度可低至1%;检测MP的灵敏度低至10拷贝,检测A2063G耐药突变比例的灵敏度低至0.01%。探针ASPCR方法与前期建立的染料ASPCR方法检测临床样本的MP感染结果一致,MP阳性检出率均为94.83%(55/58),高于传统巣式PCR联合测序方法的检测结果(75.86%,44/58);探针ASPCR和染料ASPCR 2种方法检测MP耐药率分别为63.64%(35/55)、70.91%(39/55),高于传统巣式PCR联合测序方法检测结果59.09%(26/44)。结论?新建探针ASPCR方法是一种具有高特异度、准确度和灵敏度的快速检测MP微量A2063G耐药突变的方法;与染料ASPCR方法相比,探针ASPCR方法检测耐药MP的灵敏度略低,但其临床样本检测复查率也低于染料ASPCR方法,且其结果判读简单,更适合在临床中应用推广,能够为临床制定MP及耐药MP感染的治疗方案提供理论依据。
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关 键 词: | 肺炎支原体 ASPCR 实时定量 探针 23S rRNA A2063G 咽拭子 |
Development of probe-based Allele-specific real-time PCR testingfor
detection of minor A2063G resistance mutation in Mycoplasma Pneumoniae |
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Abstract: | |
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Keywords: | Mycoplasma pneumoniae Allele-specific real-time PCR probe 23S rRNA A2063G throat swab |
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