| 山东省11株人星状病毒的全基因组序列特征分析题录 |
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| 引用本文： | 陈萌,徐明怡,刘尧,林小娟,许金珂,王素婷,徐爱强,陶泽新.山东省11株人星状病毒的全基因组序列特征分析题录[J].中华预防医学杂志,2024(1). |
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| 作者姓名： | 陈萌 徐明怡 刘尧 林小娟 许金珂 王素婷 徐爱强 陶泽新 |
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| 作者单位： | 1. 山东省疾病预防控制中心免疫预防管理所;2. 山东省职业卫生与职业病防治研究院临床检验科 |
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| 基金项目： | 山东省自然科学基金面上项目(ZR2020MH337)； |
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| 摘 要： | 目的了解山东省人星状病毒(HAstV)的全基因组特征。方法收集山东省2020—2022年急性弛缓性麻痹病例监测系统的粪便标本, 采用实时荧光定量PCR检测HAstV核酸, 针对阳性标本应用下一代测序技术对HAstV的全基因组序列进行测定和分析, 进行型别鉴定, 使用BioEdit和Mega软件进行同源性比较和系统发生学分析。结果共检测了667份标本, 14份为HAstV核酸阳性(2.1%), 其中HAstV-1基因型6份, MLB1基因型6份, MLB2基因型1份, VA2基因型1份。共有11份标本获得了全基因组序列。其中, 6株HAstV-1型本地序列之间的核苷酸相似性为98.2%～99.9%, 与其他地区HAstV-1的全基因组序列的核苷酸相似性为87.6%～98.6%;4株MLB1型本地序列之间的核苷酸相似性为99.1%～99.9%, 与其他地区的MLB1型全基因组序列相似性为92.2%～99.4%;1株VA2型本地序列与其他VA2型全基因组序列相似性为96.0%～96.3%。基于ORF2编码区的系统发生学结果显示, HAstV-1型本地序列与日本株具有较为密切的亲缘关系, 且与...
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| 关 键 词： | 病毒 基因扩增 人星状病毒 宏基因组测序 |
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