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2010年广州地区儿童肠道病毒71型感染的分子流行病学研究
引用本文:朱冰,钟家禹,邝璐,华亮,肖密丝,陈翊,谢嘉慧,张莹莹.2010年广州地区儿童肠道病毒71型感染的分子流行病学研究[J].中华医院感染学杂志,2011,21(12):2401-2403.
作者姓名:朱冰  钟家禹  邝璐  华亮  肖密丝  陈翊  谢嘉慧  张莹莹
作者单位:广州市妇女儿童医疗中心病毒研究室,广东,广州,510120
基金项目:国家自然基金面上项目,广东省自然科学基金项目
摘    要:目的了解广州地区2010年肠道病毒(EV)71病毒流行状况。方法设计肠道病毒71型实时荧光RT-PCR引物和TaqMan探针,运用TaqMan实时荧光RT-PCR技术,对2010年全年来医院就诊的疑似手口足病患儿送检标本20150份,进行肠道病毒71型荧光RT-PCR检测,同时,设计了扩增EV71病毒全基因组的引物,随机选取了5株病毒进行全基因组进行测定。结果在20150份临床标本中,EV71病毒的阳性为4780份,全年总的检出率为23.72%,每个月均有阳性检出;其中,EV71病毒阳性率较高的为4~7月份,最高检出率为6月份,达32.19%,最低检出率为10月份,为7.91%;扩增了5株广州株EV71病毒全基因组全长序列,提交到GenBank上,将5株广州株EV71病毒与EV71的A、B3、B4、B5、C1、C2、C3、C4型及阜阳株全基因组核苷酸序列进行ClustalW比较,发现与C4a型阜阳株等同源性为98.00%~99.00%,与C4b同源性为91.00%~93.00%,与C1-C3同源性为82.00%~83.00%,与B3、B4、B5同源性为81.00%~83.00%,与A型同源性为80.00%。结论 2010年广州地区手足口病的主要病原是肠道病毒71型,EV71病毒在2010年全年还是较普遍流行,全基因组序列分析表明,2010年分离的5株广州株EV71病毒属于C4a型。

关 键 词:肠道病毒71型  流行病学  TaqMan实时荧光RT-PCR

Molecular epidemiology study on human enterovirus 71 virus infection in Guangzhou in 2010
ZHU Bing,ZHONG Jia-yu,KUANG Lu,HUA Liang,XIAO Mi-si,CHEN Yi,XIE Jia-hui,ZHANG Ying-ying.Molecular epidemiology study on human enterovirus 71 virus infection in Guangzhou in 2010[J].Chinese Journal of Nosocomiology,2011,21(12):2401-2403.
Authors:ZHU Bing  ZHONG Jia-yu  KUANG Lu  HUA Liang  XIAO Mi-si  CHEN Yi  XIE Jia-hui  ZHANG Ying-ying
Institution:ZHU Bing,ZHONG Jia-yu,KUANG Lu,HUA Liang,XIAO Mi-si,CHEN Yi,XIE Jia-hui,ZHANG Ying-ying(Guangzhou Medical Center for Women and Children,Guangzhou,Guangdong 510120,China)
Abstract:OBJECTIVE To study the molecular epidemiology of Human enterovirus 71 in Guangzhou in 2010 full year.METHODS Developed real-timeTaqMan RT-PCR for rapid detection of EV71 virus.A total 20150 clinical specimens were obtained from pediatric patients suspected HFMD in 2010 r.Primers were designed and amplified EV71 genome by RT-PCR.RESULTS Totally 4780 human entervirus 71 were indentified from 20150 samples and carrying rate of EV71 virus was 23.72%,relatively high positive rates of EV71 virus were Apr,May,Jun ...
Keywords:Enterovirus 71  Epidemiology  TaqMan RT-PCR  
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