肠出血性大肠埃希菌遗传基因分型方法比较 |
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引用本文: | 裴迎新,王晓平,苏华,寺岛 淳,王滨有.肠出血性大肠埃希菌遗传基因分型方法比较[J].中国公共卫生,2008,24(5):525-527. |
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作者姓名: | 裴迎新 王晓平 苏华 寺岛 淳 王滨有 |
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作者单位: | 1. 黑龙江省疾病预防控制中心,哈尔滨,150030;哈尔滨医科大学公共卫生学院 2. 黑龙江省疾病预防控制中心,哈尔滨,150030 3. 日本国立感染症研究所 4. 哈尔滨医科大学公共卫生学院 |
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摘 要: | 目的 对肠出血性大肠埃希菌(EHEC)O157:H7的遗传基因型别进行不同分子分型方法的对比研究,以对EHEC的分子流行病学追踪提供更为行之有效的方法.方法 采用核酸脉冲场凝胶电泳(PFGE)与多位点串联重复序列(VNTR)分析(MLVA)两种方法对16株EHEC O157:H7进行分析.结果 在PFGE的研究中,依据经XbaI及确认BlnI酶切后,具有相同电泳图谱的菌株被定义为PFGE同一群落的菌株,将16株菌株分成6个型别.MLVA通过对9个位点的串联重复序列的比较研究,16株菌株在3个位点上没有显示出区别,在另外6个位点上等位基因的数目为2~7种,16株细菌被分为14个MLVA的型别.流行病学资料表明,这些菌株为散发病例分离株,分离地域上基本没有关联,因此,MLVA的结果与流行病学信息高度相关.结论 MLVA能够区分无法区分的PFGE型别,且可以区分来自于不同地理区域的散发菌株,具有区分肠出血性大肠埃希菌O157:H7的潜力.
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关 键 词: | 肠出血性大肠埃希菌O157:H7 核酸脉冲场凝胶电泳(PFGE) 多位点串联重复序列(VNTR)分析(ML-VA) 分型 肠出血性 大肠埃希菌 遗传基因 分型方法 比较 Escherichia coli genotype Study analysis tandem repeat number variable multiple 地理区域 相关 高度 信息 关联 地域 分离株 |
文章编号: | 1001-0580(2008)05-0525-03 |
修稿时间: | 2008年1月2日 |
Study on genotype of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 isolates by pulsed-field gel electrophoresis and multiple -locus variable number tandem repeat analysis |
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